Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA47

CCDC63, Coiled-coil domain-containing protein 63, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC63Q8NA47 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC63Q8NA47 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC63Q8NA47 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC63Q8NA47 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC63Q8NA47 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC63Q8NA47 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC63Q8NA47 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC63Q8NA47 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC63Q8NA47 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC63Q8NA47 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC63Q8NA47 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC63Q8NA47 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC63Q8NA47 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC63Q8NA47 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC63Q8NA47 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC63Q8NA47 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC63Q8NA47 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC63Q8NA47 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC63Q8NA47 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC63Q8NA47 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC63Q8NA47 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC63Q8NA47 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC63Q8NA47 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC63Q8NA47 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC63Q8NA47 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC63Q8NA47 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC63Q8NA47 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC63Q8NA47 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC63Q8NA47 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC63Q8NA47 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC63Q8NA47 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC63Q8NA47 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC63Q8NA47 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC63Q8NA47 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC63Q8NA47 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC63Q8NA47 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CCDC63Q8NA47 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC63Q8NA47 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC63Q8NA47 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC63Q8NA47 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC63Q8NA47 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC63Q8NA47 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC63Q8NA47 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC63Q8NA47 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC63Q8NA47 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC63Q8NA47 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC63Q8NA47 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC63Q8NA47 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC63Q8NA47 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC63Q8NA47 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC63Q8NA47 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC63Q8NA47 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC63Q8NA47 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC63Q8NA47 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC63Q8NA47 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC63Q8NA47 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC63Q8NA47 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC63Q8NA47 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC63Q8NA47 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC63Q8NA47 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC63Q8NA47 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC63Q8NA47 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC63Q8NA47 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC63Q8NA47 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC63Q8NA47 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC63Q8NA47 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC63Q8NA47 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC63Q8NA47 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC63Q8NA47 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC63Q8NA47 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC63Q8NA47 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC63Q8NA47 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC63Q8NA47 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC63Q8NA47 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC63Q8NA47 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC63Q8NA47 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC63Q8NA47 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC63Q8NA47 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC63Q8NA47 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC63Q8NA47 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC63Q8NA47 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC63Q8NA47 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC63Q8NA47 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC63Q8NA47 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC63Q8NA47 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC63Q8NA47 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC63Q8NA47 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC63Q8NA47 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC63Q8NA47 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC63Q8NA47 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC63Q8NA47 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC63Q8NA47 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC63Q8NA47 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC63Q8NA47 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC63Q8NA47 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC63Q8NA47 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC63Q8NA47 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC63Q8NA47 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC63Q8NA47 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC63Q8NA47 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.6 ms