Protein–RNA interactions for Protein: Q8N7C7

RNF148, RING finger protein 148, humanhuman

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Length 305 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF148Q8N7C7 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RNF148Q8N7C7 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RNF148Q8N7C7 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RNF148Q8N7C7 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RNF148Q8N7C7 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RNF148Q8N7C7 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RNF148Q8N7C7 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RNF148Q8N7C7 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RNF148Q8N7C7 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
RNF148Q8N7C7 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RNF148Q8N7C7 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RNF148Q8N7C7 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RNF148Q8N7C7 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RNF148Q8N7C7 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RNF148Q8N7C7 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
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RNF148Q8N7C7 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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RNF148Q8N7C7 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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RNF148Q8N7C7 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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RNF148Q8N7C7 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
RNF148Q8N7C7 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
RNF148Q8N7C7 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
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RNF148Q8N7C7 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RNF148Q8N7C7 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RNF148Q8N7C7 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RNF148Q8N7C7 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RNF148Q8N7C7 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RNF148Q8N7C7 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RNF148Q8N7C7 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RNF148Q8N7C7 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
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RNF148Q8N7C7 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
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