Protein–RNA interactions for Protein: Q8N144

GJD3, Gap junction delta-3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 294 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJD3Q8N144 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GJD3Q8N144 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GJD3Q8N144 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GJD3Q8N144 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GJD3Q8N144 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GJD3Q8N144 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
GJD3Q8N144 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GJD3Q8N144 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
GJD3Q8N144 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GJD3Q8N144 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GJD3Q8N144 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GJD3Q8N144 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GJD3Q8N144 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GJD3Q8N144 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
GJD3Q8N144 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GJD3Q8N144 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
GJD3Q8N144 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GJD3Q8N144 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GJD3Q8N144 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GJD3Q8N144 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GJD3Q8N144 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GJD3Q8N144 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GJD3Q8N144 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GJD3Q8N144 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GJD3Q8N144 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GJD3Q8N144 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GJD3Q8N144 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GJD3Q8N144 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GJD3Q8N144 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GJD3Q8N144 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GJD3Q8N144 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GJD3Q8N144 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
GJD3Q8N144 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GJD3Q8N144 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GJD3Q8N144 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GJD3Q8N144 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GJD3Q8N144 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GJD3Q8N144 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GJD3Q8N144 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GJD3Q8N144 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GJD3Q8N144 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GJD3Q8N144 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GJD3Q8N144 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GJD3Q8N144 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
GJD3Q8N144 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
GJD3Q8N144 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GJD3Q8N144 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GJD3Q8N144 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GJD3Q8N144 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GJD3Q8N144 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GJD3Q8N144 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GJD3Q8N144 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GJD3Q8N144 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GJD3Q8N144 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GJD3Q8N144 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GJD3Q8N144 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GJD3Q8N144 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GJD3Q8N144 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
GJD3Q8N144 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
GJD3Q8N144 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
GJD3Q8N144 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GJD3Q8N144 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GJD3Q8N144 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GJD3Q8N144 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GJD3Q8N144 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GJD3Q8N144 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GJD3Q8N144 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GJD3Q8N144 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GJD3Q8N144 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
GJD3Q8N144 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GJD3Q8N144 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GJD3Q8N144 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GJD3Q8N144 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GJD3Q8N144 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GJD3Q8N144 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GJD3Q8N144 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
GJD3Q8N144 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GJD3Q8N144 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GJD3Q8N144 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GJD3Q8N144 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
GJD3Q8N144 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GJD3Q8N144 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GJD3Q8N144 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
GJD3Q8N144 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GJD3Q8N144 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GJD3Q8N144 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GJD3Q8N144 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GJD3Q8N144 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GJD3Q8N144 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GJD3Q8N144 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GJD3Q8N144 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GJD3Q8N144 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GJD3Q8N144 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GJD3Q8N144 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GJD3Q8N144 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GJD3Q8N144 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GJD3Q8N144 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
GJD3Q8N144 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GJD3Q8N144 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GJD3Q8N144 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms