Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVW4

CDKL3, Cyclin-dependent kinase-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL3Q8IVW4 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDKL3Q8IVW4 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDKL3Q8IVW4 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
CDKL3Q8IVW4 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDKL3Q8IVW4 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDKL3Q8IVW4 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDKL3Q8IVW4 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDKL3Q8IVW4 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDKL3Q8IVW4 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDKL3Q8IVW4 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDKL3Q8IVW4 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDKL3Q8IVW4 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDKL3Q8IVW4 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDKL3Q8IVW4 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDKL3Q8IVW4 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDKL3Q8IVW4 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDKL3Q8IVW4 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDKL3Q8IVW4 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDKL3Q8IVW4 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDKL3Q8IVW4 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDKL3Q8IVW4 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDKL3Q8IVW4 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDKL3Q8IVW4 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDKL3Q8IVW4 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CDKL3Q8IVW4 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDKL3Q8IVW4 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDKL3Q8IVW4 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDKL3Q8IVW4 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDKL3Q8IVW4 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDKL3Q8IVW4 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDKL3Q8IVW4 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDKL3Q8IVW4 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDKL3Q8IVW4 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDKL3Q8IVW4 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDKL3Q8IVW4 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDKL3Q8IVW4 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDKL3Q8IVW4 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDKL3Q8IVW4 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDKL3Q8IVW4 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDKL3Q8IVW4 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDKL3Q8IVW4 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDKL3Q8IVW4 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDKL3Q8IVW4 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDKL3Q8IVW4 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDKL3Q8IVW4 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDKL3Q8IVW4 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDKL3Q8IVW4 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDKL3Q8IVW4 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDKL3Q8IVW4 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDKL3Q8IVW4 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDKL3Q8IVW4 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDKL3Q8IVW4 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CDKL3Q8IVW4 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDKL3Q8IVW4 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CDKL3Q8IVW4 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CDKL3Q8IVW4 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDKL3Q8IVW4 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDKL3Q8IVW4 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CDKL3Q8IVW4 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDKL3Q8IVW4 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDKL3Q8IVW4 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDKL3Q8IVW4 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDKL3Q8IVW4 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDKL3Q8IVW4 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDKL3Q8IVW4 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDKL3Q8IVW4 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDKL3Q8IVW4 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDKL3Q8IVW4 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDKL3Q8IVW4 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDKL3Q8IVW4 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDKL3Q8IVW4 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDKL3Q8IVW4 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDKL3Q8IVW4 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDKL3Q8IVW4 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDKL3Q8IVW4 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDKL3Q8IVW4 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDKL3Q8IVW4 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDKL3Q8IVW4 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDKL3Q8IVW4 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDKL3Q8IVW4 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDKL3Q8IVW4 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDKL3Q8IVW4 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDKL3Q8IVW4 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDKL3Q8IVW4 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CDKL3Q8IVW4 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CDKL3Q8IVW4 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDKL3Q8IVW4 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDKL3Q8IVW4 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDKL3Q8IVW4 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDKL3Q8IVW4 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDKL3Q8IVW4 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDKL3Q8IVW4 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDKL3Q8IVW4 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDKL3Q8IVW4 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDKL3Q8IVW4 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDKL3Q8IVW4 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDKL3Q8IVW4 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDKL3Q8IVW4 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDKL3Q8IVW4 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDKL3Q8IVW4 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms