Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU4

BHLHA9, Class A basic helix-loop-helix protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHA9Q7RTU4 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
BHLHA9Q7RTU4 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BHLHA9Q7RTU4 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BHLHA9Q7RTU4 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BHLHA9Q7RTU4 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BHLHA9Q7RTU4 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BHLHA9Q7RTU4 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
BHLHA9Q7RTU4 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BHLHA9Q7RTU4 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BHLHA9Q7RTU4 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
BHLHA9Q7RTU4 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BHLHA9Q7RTU4 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
BHLHA9Q7RTU4 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
BHLHA9Q7RTU4 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
BHLHA9Q7RTU4 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
BHLHA9Q7RTU4 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
BHLHA9Q7RTU4 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
BHLHA9Q7RTU4 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BHLHA9Q7RTU4 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
BHLHA9Q7RTU4 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BHLHA9Q7RTU4 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
BHLHA9Q7RTU4 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
BHLHA9Q7RTU4 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
BHLHA9Q7RTU4 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
BHLHA9Q7RTU4 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BHLHA9Q7RTU4 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
BHLHA9Q7RTU4 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
BHLHA9Q7RTU4 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
BHLHA9Q7RTU4 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
BHLHA9Q7RTU4 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
BHLHA9Q7RTU4 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
BHLHA9Q7RTU4 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
BHLHA9Q7RTU4 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
BHLHA9Q7RTU4 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
BHLHA9Q7RTU4 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
BHLHA9Q7RTU4 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
BHLHA9Q7RTU4 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
BHLHA9Q7RTU4 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
BHLHA9Q7RTU4 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BHLHA9Q7RTU4 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
BHLHA9Q7RTU4 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
BHLHA9Q7RTU4 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
BHLHA9Q7RTU4 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
BHLHA9Q7RTU4 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BHLHA9Q7RTU4 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
BHLHA9Q7RTU4 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
BHLHA9Q7RTU4 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BHLHA9Q7RTU4 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BHLHA9Q7RTU4 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
BHLHA9Q7RTU4 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BHLHA9Q7RTU4 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
BHLHA9Q7RTU4 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BHLHA9Q7RTU4 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BHLHA9Q7RTU4 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BHLHA9Q7RTU4 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BHLHA9Q7RTU4 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BHLHA9Q7RTU4 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
BHLHA9Q7RTU4 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BHLHA9Q7RTU4 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BHLHA9Q7RTU4 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BHLHA9Q7RTU4 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BHLHA9Q7RTU4 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BHLHA9Q7RTU4 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BHLHA9Q7RTU4 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BHLHA9Q7RTU4 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BHLHA9Q7RTU4 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BHLHA9Q7RTU4 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BHLHA9Q7RTU4 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BHLHA9Q7RTU4 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BHLHA9Q7RTU4 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BHLHA9Q7RTU4 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BHLHA9Q7RTU4 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BHLHA9Q7RTU4 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
BHLHA9Q7RTU4 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BHLHA9Q7RTU4 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BHLHA9Q7RTU4 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
BHLHA9Q7RTU4 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BHLHA9Q7RTU4 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BHLHA9Q7RTU4 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BHLHA9Q7RTU4 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BHLHA9Q7RTU4 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BHLHA9Q7RTU4 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BHLHA9Q7RTU4 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BHLHA9Q7RTU4 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BHLHA9Q7RTU4 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BHLHA9Q7RTU4 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BHLHA9Q7RTU4 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BHLHA9Q7RTU4 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BHLHA9Q7RTU4 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BHLHA9Q7RTU4 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BHLHA9Q7RTU4 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BHLHA9Q7RTU4 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BHLHA9Q7RTU4 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BHLHA9Q7RTU4 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BHLHA9Q7RTU4 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BHLHA9Q7RTU4 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BHLHA9Q7RTU4 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BHLHA9Q7RTU4 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BHLHA9Q7RTU4 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BHLHA9Q7RTU4 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms