Protein–RNA interactions for Protein: Q6XLA1

CASC2, Protein CASC2, isoform 3, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASC2Q6XLA1 DSE-201ENST00000331677 7237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
CASC2Q6XLA1 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
CASC2Q6XLA1 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
CASC2Q6XLA1 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
CASC2Q6XLA1 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
CASC2Q6XLA1 IRS1-201ENST00000305123 9705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
CASC2Q6XLA1 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
CASC2Q6XLA1 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
CASC2Q6XLA1 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
CASC2Q6XLA1 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
CASC2Q6XLA1 USP47-202ENST00000339865 7775 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
CASC2Q6XLA1 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
CASC2Q6XLA1 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
CASC2Q6XLA1 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
CASC2Q6XLA1 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
CASC2Q6XLA1 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
CASC2Q6XLA1 ALX4-201ENST00000329255 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
CASC2Q6XLA1 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
CASC2Q6XLA1 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
CASC2Q6XLA1 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
CASC2Q6XLA1 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
CASC2Q6XLA1 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
CASC2Q6XLA1 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
CASC2Q6XLA1 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
CASC2Q6XLA1 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
CASC2Q6XLA1 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
CASC2Q6XLA1 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
CASC2Q6XLA1 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC10.34□□□□□ -0.75
CASC2Q6XLA1 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
CASC2Q6XLA1 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.34□□□□□ -0.75
CASC2Q6XLA1 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
CASC2Q6XLA1 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
CASC2Q6XLA1 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
CASC2Q6XLA1 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
CASC2Q6XLA1 DKFZP434A062-201ENST00000573103 5021 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
CASC2Q6XLA1 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
CASC2Q6XLA1 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
CASC2Q6XLA1 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
CASC2Q6XLA1 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
CASC2Q6XLA1 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
CASC2Q6XLA1 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
CASC2Q6XLA1 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
CASC2Q6XLA1 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
CASC2Q6XLA1 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
CASC2Q6XLA1 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
CASC2Q6XLA1 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
CASC2Q6XLA1 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
CASC2Q6XLA1 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
CASC2Q6XLA1 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
CASC2Q6XLA1 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
CASC2Q6XLA1 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
CASC2Q6XLA1 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
CASC2Q6XLA1 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
CASC2Q6XLA1 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
CASC2Q6XLA1 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
CASC2Q6XLA1 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
CASC2Q6XLA1 CERS6-202ENST00000392687 6851 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
CASC2Q6XLA1 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
CASC2Q6XLA1 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
CASC2Q6XLA1 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
CASC2Q6XLA1 REV3L-207ENST00000435970 10943 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
CASC2Q6XLA1 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
CASC2Q6XLA1 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
CASC2Q6XLA1 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
CASC2Q6XLA1 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
CASC2Q6XLA1 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
CASC2Q6XLA1 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
CASC2Q6XLA1 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
CASC2Q6XLA1 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
CASC2Q6XLA1 SFMBT2-204ENST00000397167 8024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
CASC2Q6XLA1 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
CASC2Q6XLA1 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
CASC2Q6XLA1 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
CASC2Q6XLA1 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
CASC2Q6XLA1 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
CASC2Q6XLA1 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
CASC2Q6XLA1 FLNC-202ENST00000346177 9042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
CASC2Q6XLA1 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
CASC2Q6XLA1 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
CASC2Q6XLA1 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
CASC2Q6XLA1 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
CASC2Q6XLA1 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
CASC2Q6XLA1 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
CASC2Q6XLA1 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
CASC2Q6XLA1 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
CASC2Q6XLA1 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
CASC2Q6XLA1 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
CASC2Q6XLA1 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
CASC2Q6XLA1 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
CASC2Q6XLA1 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
CASC2Q6XLA1 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
CASC2Q6XLA1 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
CASC2Q6XLA1 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
CASC2Q6XLA1 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
CASC2Q6XLA1 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
CASC2Q6XLA1 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
CASC2Q6XLA1 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
CASC2Q6XLA1 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
CASC2Q6XLA1 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
CASC2Q6XLA1 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.6 ms