Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWZ7

ABRAXAS1, BRCA1-A complex subunit Abraxas 1, humanhuman

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ABRAXAS1Q6UWZ7 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ABRAXAS1Q6UWZ7 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ABRAXAS1Q6UWZ7 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ABRAXAS1Q6UWZ7 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ABRAXAS1Q6UWZ7 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ABRAXAS1Q6UWZ7 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ABRAXAS1Q6UWZ7 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ABRAXAS1Q6UWZ7 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ABRAXAS1Q6UWZ7 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ABRAXAS1Q6UWZ7 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ABRAXAS1Q6UWZ7 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ABRAXAS1Q6UWZ7 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ABRAXAS1Q6UWZ7 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ABRAXAS1Q6UWZ7 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ABRAXAS1Q6UWZ7 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ABRAXAS1Q6UWZ7 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ABRAXAS1Q6UWZ7 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ABRAXAS1Q6UWZ7 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ABRAXAS1Q6UWZ7 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ABRAXAS1Q6UWZ7 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ABRAXAS1Q6UWZ7 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ABRAXAS1Q6UWZ7 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ABRAXAS1Q6UWZ7 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ABRAXAS1Q6UWZ7 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ABRAXAS1Q6UWZ7 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ABRAXAS1Q6UWZ7 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ABRAXAS1Q6UWZ7 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ABRAXAS1Q6UWZ7 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ABRAXAS1Q6UWZ7 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ABRAXAS1Q6UWZ7 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
ABRAXAS1Q6UWZ7 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ABRAXAS1Q6UWZ7 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ABRAXAS1Q6UWZ7 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ABRAXAS1Q6UWZ7 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ABRAXAS1Q6UWZ7 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ABRAXAS1Q6UWZ7 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ABRAXAS1Q6UWZ7 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ABRAXAS1Q6UWZ7 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ABRAXAS1Q6UWZ7 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ABRAXAS1Q6UWZ7 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ABRAXAS1Q6UWZ7 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
ABRAXAS1Q6UWZ7 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ABRAXAS1Q6UWZ7 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ABRAXAS1Q6UWZ7 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ABRAXAS1Q6UWZ7 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ABRAXAS1Q6UWZ7 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ABRAXAS1Q6UWZ7 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ABRAXAS1Q6UWZ7 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ABRAXAS1Q6UWZ7 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ABRAXAS1Q6UWZ7 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ABRAXAS1Q6UWZ7 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ABRAXAS1Q6UWZ7 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ABRAXAS1Q6UWZ7 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ABRAXAS1Q6UWZ7 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ABRAXAS1Q6UWZ7 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ABRAXAS1Q6UWZ7 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ABRAXAS1Q6UWZ7 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ABRAXAS1Q6UWZ7 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ABRAXAS1Q6UWZ7 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ABRAXAS1Q6UWZ7 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ABRAXAS1Q6UWZ7 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ABRAXAS1Q6UWZ7 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ABRAXAS1Q6UWZ7 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
ABRAXAS1Q6UWZ7 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
ABRAXAS1Q6UWZ7 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ABRAXAS1Q6UWZ7 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
ABRAXAS1Q6UWZ7 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ABRAXAS1Q6UWZ7 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ABRAXAS1Q6UWZ7 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ABRAXAS1Q6UWZ7 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ABRAXAS1Q6UWZ7 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ABRAXAS1Q6UWZ7 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ABRAXAS1Q6UWZ7 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ABRAXAS1Q6UWZ7 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ABRAXAS1Q6UWZ7 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ABRAXAS1Q6UWZ7 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ABRAXAS1Q6UWZ7 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ABRAXAS1Q6UWZ7 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ABRAXAS1Q6UWZ7 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ABRAXAS1Q6UWZ7 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ABRAXAS1Q6UWZ7 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ABRAXAS1Q6UWZ7 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ABRAXAS1Q6UWZ7 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ABRAXAS1Q6UWZ7 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ABRAXAS1Q6UWZ7 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ABRAXAS1Q6UWZ7 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ABRAXAS1Q6UWZ7 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ABRAXAS1Q6UWZ7 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ABRAXAS1Q6UWZ7 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ABRAXAS1Q6UWZ7 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ABRAXAS1Q6UWZ7 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms