Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWL2

SUSD1, Sushi domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD1Q6UWL2 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SUSD1Q6UWL2 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SUSD1Q6UWL2 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SUSD1Q6UWL2 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SUSD1Q6UWL2 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SUSD1Q6UWL2 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SUSD1Q6UWL2 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SUSD1Q6UWL2 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SUSD1Q6UWL2 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SUSD1Q6UWL2 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SUSD1Q6UWL2 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SUSD1Q6UWL2 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SUSD1Q6UWL2 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SUSD1Q6UWL2 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SUSD1Q6UWL2 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SUSD1Q6UWL2 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SUSD1Q6UWL2 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SUSD1Q6UWL2 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SUSD1Q6UWL2 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SUSD1Q6UWL2 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SUSD1Q6UWL2 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SUSD1Q6UWL2 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SUSD1Q6UWL2 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SUSD1Q6UWL2 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SUSD1Q6UWL2 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SUSD1Q6UWL2 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SUSD1Q6UWL2 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SUSD1Q6UWL2 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SUSD1Q6UWL2 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SUSD1Q6UWL2 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
SUSD1Q6UWL2 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SUSD1Q6UWL2 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SUSD1Q6UWL2 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SUSD1Q6UWL2 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
SUSD1Q6UWL2 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SUSD1Q6UWL2 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SUSD1Q6UWL2 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SUSD1Q6UWL2 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SUSD1Q6UWL2 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SUSD1Q6UWL2 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SUSD1Q6UWL2 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SUSD1Q6UWL2 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SUSD1Q6UWL2 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SUSD1Q6UWL2 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SUSD1Q6UWL2 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SUSD1Q6UWL2 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SUSD1Q6UWL2 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SUSD1Q6UWL2 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SUSD1Q6UWL2 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SUSD1Q6UWL2 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SUSD1Q6UWL2 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SUSD1Q6UWL2 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SUSD1Q6UWL2 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SUSD1Q6UWL2 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SUSD1Q6UWL2 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SUSD1Q6UWL2 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SUSD1Q6UWL2 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SUSD1Q6UWL2 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
SUSD1Q6UWL2 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SUSD1Q6UWL2 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
SUSD1Q6UWL2 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SUSD1Q6UWL2 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SUSD1Q6UWL2 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SUSD1Q6UWL2 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SUSD1Q6UWL2 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SUSD1Q6UWL2 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SUSD1Q6UWL2 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SUSD1Q6UWL2 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SUSD1Q6UWL2 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SUSD1Q6UWL2 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SUSD1Q6UWL2 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SUSD1Q6UWL2 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SUSD1Q6UWL2 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SUSD1Q6UWL2 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SUSD1Q6UWL2 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SUSD1Q6UWL2 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SUSD1Q6UWL2 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SUSD1Q6UWL2 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SUSD1Q6UWL2 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SUSD1Q6UWL2 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SUSD1Q6UWL2 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SUSD1Q6UWL2 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SUSD1Q6UWL2 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SUSD1Q6UWL2 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SUSD1Q6UWL2 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SUSD1Q6UWL2 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
SUSD1Q6UWL2 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
SUSD1Q6UWL2 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SUSD1Q6UWL2 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SUSD1Q6UWL2 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SUSD1Q6UWL2 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SUSD1Q6UWL2 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SUSD1Q6UWL2 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SUSD1Q6UWL2 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SUSD1Q6UWL2 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SUSD1Q6UWL2 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SUSD1Q6UWL2 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SUSD1Q6UWL2 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SUSD1Q6UWL2 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SUSD1Q6UWL2 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms