Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCD5

RFWD3, E3 ubiquitin-protein ligase RFWD3, humanhuman

Predictions only

Length 774 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFWD3Q6PCD5 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RFWD3Q6PCD5 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RFWD3Q6PCD5 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RFWD3Q6PCD5 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RFWD3Q6PCD5 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RFWD3Q6PCD5 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RFWD3Q6PCD5 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RFWD3Q6PCD5 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RFWD3Q6PCD5 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RFWD3Q6PCD5 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RFWD3Q6PCD5 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
RFWD3Q6PCD5 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RFWD3Q6PCD5 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
RFWD3Q6PCD5 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RFWD3Q6PCD5 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RFWD3Q6PCD5 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RFWD3Q6PCD5 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RFWD3Q6PCD5 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RFWD3Q6PCD5 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RFWD3Q6PCD5 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RFWD3Q6PCD5 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RFWD3Q6PCD5 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RFWD3Q6PCD5 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RFWD3Q6PCD5 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RFWD3Q6PCD5 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RFWD3Q6PCD5 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RFWD3Q6PCD5 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RFWD3Q6PCD5 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RFWD3Q6PCD5 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RFWD3Q6PCD5 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RFWD3Q6PCD5 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RFWD3Q6PCD5 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RFWD3Q6PCD5 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RFWD3Q6PCD5 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RFWD3Q6PCD5 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RFWD3Q6PCD5 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RFWD3Q6PCD5 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RFWD3Q6PCD5 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RFWD3Q6PCD5 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RFWD3Q6PCD5 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RFWD3Q6PCD5 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RFWD3Q6PCD5 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RFWD3Q6PCD5 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
RFWD3Q6PCD5 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
RFWD3Q6PCD5 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RFWD3Q6PCD5 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RFWD3Q6PCD5 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RFWD3Q6PCD5 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RFWD3Q6PCD5 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RFWD3Q6PCD5 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RFWD3Q6PCD5 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RFWD3Q6PCD5 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RFWD3Q6PCD5 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RFWD3Q6PCD5 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RFWD3Q6PCD5 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RFWD3Q6PCD5 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RFWD3Q6PCD5 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RFWD3Q6PCD5 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RFWD3Q6PCD5 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RFWD3Q6PCD5 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RFWD3Q6PCD5 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RFWD3Q6PCD5 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RFWD3Q6PCD5 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RFWD3Q6PCD5 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RFWD3Q6PCD5 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RFWD3Q6PCD5 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RFWD3Q6PCD5 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RFWD3Q6PCD5 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RFWD3Q6PCD5 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RFWD3Q6PCD5 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RFWD3Q6PCD5 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RFWD3Q6PCD5 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RFWD3Q6PCD5 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RFWD3Q6PCD5 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RFWD3Q6PCD5 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RFWD3Q6PCD5 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RFWD3Q6PCD5 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RFWD3Q6PCD5 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RFWD3Q6PCD5 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RFWD3Q6PCD5 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RFWD3Q6PCD5 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RFWD3Q6PCD5 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RFWD3Q6PCD5 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RFWD3Q6PCD5 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RFWD3Q6PCD5 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RFWD3Q6PCD5 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RFWD3Q6PCD5 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RFWD3Q6PCD5 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RFWD3Q6PCD5 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RFWD3Q6PCD5 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RFWD3Q6PCD5 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RFWD3Q6PCD5 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RFWD3Q6PCD5 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RFWD3Q6PCD5 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RFWD3Q6PCD5 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RFWD3Q6PCD5 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
RFWD3Q6PCD5 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RFWD3Q6PCD5 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RFWD3Q6PCD5 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RFWD3Q6PCD5 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms