Protein–RNA interactions for Protein: Q6KB66

KRT80, Keratin, type II cytoskeletal 80, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT80Q6KB66 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KRT80Q6KB66 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
KRT80Q6KB66 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KRT80Q6KB66 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KRT80Q6KB66 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
KRT80Q6KB66 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
KRT80Q6KB66 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KRT80Q6KB66 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KRT80Q6KB66 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KRT80Q6KB66 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KRT80Q6KB66 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KRT80Q6KB66 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KRT80Q6KB66 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KRT80Q6KB66 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KRT80Q6KB66 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KRT80Q6KB66 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KRT80Q6KB66 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KRT80Q6KB66 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KRT80Q6KB66 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KRT80Q6KB66 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KRT80Q6KB66 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KRT80Q6KB66 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KRT80Q6KB66 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KRT80Q6KB66 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
KRT80Q6KB66 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KRT80Q6KB66 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KRT80Q6KB66 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KRT80Q6KB66 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
KRT80Q6KB66 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
KRT80Q6KB66 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KRT80Q6KB66 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KRT80Q6KB66 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KRT80Q6KB66 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
KRT80Q6KB66 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KRT80Q6KB66 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KRT80Q6KB66 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KRT80Q6KB66 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KRT80Q6KB66 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KRT80Q6KB66 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KRT80Q6KB66 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KRT80Q6KB66 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KRT80Q6KB66 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KRT80Q6KB66 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KRT80Q6KB66 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KRT80Q6KB66 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KRT80Q6KB66 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KRT80Q6KB66 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KRT80Q6KB66 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KRT80Q6KB66 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KRT80Q6KB66 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KRT80Q6KB66 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KRT80Q6KB66 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KRT80Q6KB66 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
KRT80Q6KB66 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KRT80Q6KB66 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KRT80Q6KB66 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KRT80Q6KB66 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
KRT80Q6KB66 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
KRT80Q6KB66 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KRT80Q6KB66 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KRT80Q6KB66 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KRT80Q6KB66 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KRT80Q6KB66 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KRT80Q6KB66 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KRT80Q6KB66 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KRT80Q6KB66 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KRT80Q6KB66 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KRT80Q6KB66 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KRT80Q6KB66 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KRT80Q6KB66 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KRT80Q6KB66 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KRT80Q6KB66 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KRT80Q6KB66 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KRT80Q6KB66 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KRT80Q6KB66 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KRT80Q6KB66 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
KRT80Q6KB66 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
KRT80Q6KB66 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
KRT80Q6KB66 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
KRT80Q6KB66 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
KRT80Q6KB66 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
KRT80Q6KB66 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
KRT80Q6KB66 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
KRT80Q6KB66 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
KRT80Q6KB66 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
KRT80Q6KB66 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
KRT80Q6KB66 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
KRT80Q6KB66 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
KRT80Q6KB66 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
KRT80Q6KB66 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
KRT80Q6KB66 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
KRT80Q6KB66 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
KRT80Q6KB66 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
KRT80Q6KB66 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
KRT80Q6KB66 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
KRT80Q6KB66 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
KRT80Q6KB66 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
KRT80Q6KB66 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
KRT80Q6KB66 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
KRT80Q6KB66 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms