Protein–RNA interactions for Protein: Q5VST9

OBSCN, Obscurin, humanhuman

Predictions only

Length 7,968 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OBSCNQ5VST9 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
OBSCNQ5VST9 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
OBSCNQ5VST9 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
OBSCNQ5VST9 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
OBSCNQ5VST9 MFSD8-213ENST00000641134 1327 ntBASIC5□□□□□ -1.61
OBSCNQ5VST9 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
OBSCNQ5VST9 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
OBSCNQ5VST9 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
OBSCNQ5VST9 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
OBSCNQ5VST9 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
OBSCNQ5VST9 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
OBSCNQ5VST9 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
OBSCNQ5VST9 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
OBSCNQ5VST9 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC5□□□□□ -1.61
OBSCNQ5VST9 AL079304.1-201ENST00000554595 828 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
OBSCNQ5VST9 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC5□□□□□ -1.61
OBSCNQ5VST9 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
OBSCNQ5VST9 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
OBSCNQ5VST9 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
OBSCNQ5VST9 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
OBSCNQ5VST9 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
OBSCNQ5VST9 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
OBSCNQ5VST9 AC022497.1-201ENST00000624916 3691 ntBASIC5□□□□□ -1.61
OBSCNQ5VST9 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
OBSCNQ5VST9 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
OBSCNQ5VST9 SCN1B-202ENST00000415950 4537 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
OBSCNQ5VST9 PLCB3-201ENST00000279230 4197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
OBSCNQ5VST9 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
OBSCNQ5VST9 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
OBSCNQ5VST9 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
OBSCNQ5VST9 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC5□□□□□ -1.61
OBSCNQ5VST9 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
OBSCNQ5VST9 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC5□□□□□ -1.61
OBSCNQ5VST9 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC5□□□□□ -1.61
OBSCNQ5VST9 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC5□□□□□ -1.61
OBSCNQ5VST9 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC5□□□□□ -1.61
OBSCNQ5VST9 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
OBSCNQ5VST9 CLINT1-201ENST00000411809 3440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
OBSCNQ5VST9 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
OBSCNQ5VST9 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
OBSCNQ5VST9 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
OBSCNQ5VST9 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
OBSCNQ5VST9 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
OBSCNQ5VST9 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
OBSCNQ5VST9 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
OBSCNQ5VST9 CASKIN2-202ENST00000433559 3950 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
OBSCNQ5VST9 AL355578.1-201ENST00000607405 1328 ntBASIC5□□□□□ -1.61
OBSCNQ5VST9 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
OBSCNQ5VST9 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
OBSCNQ5VST9 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
OBSCNQ5VST9 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
OBSCNQ5VST9 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
OBSCNQ5VST9 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
OBSCNQ5VST9 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
OBSCNQ5VST9 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
OBSCNQ5VST9 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC5□□□□□ -1.61
OBSCNQ5VST9 AL137246.1-201ENST00000607072 977 ntBASIC5□□□□□ -1.61
OBSCNQ5VST9 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
OBSCNQ5VST9 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
OBSCNQ5VST9 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
OBSCNQ5VST9 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
OBSCNQ5VST9 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
OBSCNQ5VST9 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
OBSCNQ5VST9 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
OBSCNQ5VST9 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
OBSCNQ5VST9 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
OBSCNQ5VST9 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
OBSCNQ5VST9 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
OBSCNQ5VST9 COLGALT1-201ENST00000252599 3704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
OBSCNQ5VST9 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC5□□□□□ -1.61
OBSCNQ5VST9 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
OBSCNQ5VST9 ANKMY1-208ENST00000405002 3304 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
OBSCNQ5VST9 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
OBSCNQ5VST9 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
OBSCNQ5VST9 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC5□□□□□ -1.61
OBSCNQ5VST9 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
OBSCNQ5VST9 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
OBSCNQ5VST9 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
OBSCNQ5VST9 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
OBSCNQ5VST9 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
OBSCNQ5VST9 CHRNA3-201ENST00000326828 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
OBSCNQ5VST9 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
OBSCNQ5VST9 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
OBSCNQ5VST9 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
OBSCNQ5VST9 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
OBSCNQ5VST9 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
OBSCNQ5VST9 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
OBSCNQ5VST9 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
OBSCNQ5VST9 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
OBSCNQ5VST9 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
OBSCNQ5VST9 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
OBSCNQ5VST9 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
OBSCNQ5VST9 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
OBSCNQ5VST9 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
OBSCNQ5VST9 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
OBSCNQ5VST9 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
OBSCNQ5VST9 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
OBSCNQ5VST9 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
OBSCNQ5VST9 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
OBSCNQ5VST9 ERVK13-1-207ENST00000569465 3321 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
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