Protein–RNA interactions for Protein: Q5TDP6

LGSN, Lengsin, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGSNQ5TDP6 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LGSNQ5TDP6 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LGSNQ5TDP6 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LGSNQ5TDP6 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LGSNQ5TDP6 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LGSNQ5TDP6 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LGSNQ5TDP6 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LGSNQ5TDP6 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LGSNQ5TDP6 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LGSNQ5TDP6 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LGSNQ5TDP6 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LGSNQ5TDP6 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LGSNQ5TDP6 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LGSNQ5TDP6 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LGSNQ5TDP6 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LGSNQ5TDP6 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LGSNQ5TDP6 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LGSNQ5TDP6 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LGSNQ5TDP6 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LGSNQ5TDP6 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LGSNQ5TDP6 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
LGSNQ5TDP6 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LGSNQ5TDP6 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
LGSNQ5TDP6 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
LGSNQ5TDP6 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LGSNQ5TDP6 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LGSNQ5TDP6 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LGSNQ5TDP6 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
LGSNQ5TDP6 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LGSNQ5TDP6 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LGSNQ5TDP6 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LGSNQ5TDP6 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LGSNQ5TDP6 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LGSNQ5TDP6 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LGSNQ5TDP6 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LGSNQ5TDP6 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
LGSNQ5TDP6 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LGSNQ5TDP6 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LGSNQ5TDP6 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LGSNQ5TDP6 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LGSNQ5TDP6 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LGSNQ5TDP6 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LGSNQ5TDP6 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LGSNQ5TDP6 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LGSNQ5TDP6 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LGSNQ5TDP6 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LGSNQ5TDP6 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LGSNQ5TDP6 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LGSNQ5TDP6 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LGSNQ5TDP6 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LGSNQ5TDP6 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LGSNQ5TDP6 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LGSNQ5TDP6 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LGSNQ5TDP6 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LGSNQ5TDP6 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LGSNQ5TDP6 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LGSNQ5TDP6 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LGSNQ5TDP6 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LGSNQ5TDP6 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LGSNQ5TDP6 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LGSNQ5TDP6 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LGSNQ5TDP6 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LGSNQ5TDP6 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LGSNQ5TDP6 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LGSNQ5TDP6 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LGSNQ5TDP6 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LGSNQ5TDP6 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LGSNQ5TDP6 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LGSNQ5TDP6 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LGSNQ5TDP6 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LGSNQ5TDP6 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LGSNQ5TDP6 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LGSNQ5TDP6 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LGSNQ5TDP6 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LGSNQ5TDP6 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LGSNQ5TDP6 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LGSNQ5TDP6 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LGSNQ5TDP6 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LGSNQ5TDP6 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
LGSNQ5TDP6 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LGSNQ5TDP6 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
LGSNQ5TDP6 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LGSNQ5TDP6 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LGSNQ5TDP6 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LGSNQ5TDP6 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LGSNQ5TDP6 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LGSNQ5TDP6 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LGSNQ5TDP6 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LGSNQ5TDP6 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LGSNQ5TDP6 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LGSNQ5TDP6 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LGSNQ5TDP6 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LGSNQ5TDP6 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LGSNQ5TDP6 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LGSNQ5TDP6 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LGSNQ5TDP6 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LGSNQ5TDP6 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LGSNQ5TDP6 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LGSNQ5TDP6 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LGSNQ5TDP6 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.2 ms