Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWW7

C10orf55, Uncharacterized protein C10orf55, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C10orf55Q5SWW7 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
C10orf55Q5SWW7 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
C10orf55Q5SWW7 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
C10orf55Q5SWW7 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC14.18□□□□□ -0.14
C10orf55Q5SWW7 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
C10orf55Q5SWW7 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
C10orf55Q5SWW7 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
C10orf55Q5SWW7 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
C10orf55Q5SWW7 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
C10orf55Q5SWW7 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
C10orf55Q5SWW7 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
C10orf55Q5SWW7 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
C10orf55Q5SWW7 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
C10orf55Q5SWW7 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
C10orf55Q5SWW7 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC14.18□□□□□ -0.14
C10orf55Q5SWW7 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
C10orf55Q5SWW7 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
C10orf55Q5SWW7 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
C10orf55Q5SWW7 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC14.18□□□□□ -0.14
C10orf55Q5SWW7 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
C10orf55Q5SWW7 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
C10orf55Q5SWW7 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
C10orf55Q5SWW7 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
C10orf55Q5SWW7 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
C10orf55Q5SWW7 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
C10orf55Q5SWW7 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
C10orf55Q5SWW7 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
C10orf55Q5SWW7 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
C10orf55Q5SWW7 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
C10orf55Q5SWW7 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
C10orf55Q5SWW7 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
C10orf55Q5SWW7 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
C10orf55Q5SWW7 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
C10orf55Q5SWW7 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
C10orf55Q5SWW7 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
C10orf55Q5SWW7 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
C10orf55Q5SWW7 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
C10orf55Q5SWW7 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
C10orf55Q5SWW7 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
C10orf55Q5SWW7 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
C10orf55Q5SWW7 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
C10orf55Q5SWW7 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
C10orf55Q5SWW7 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
C10orf55Q5SWW7 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
C10orf55Q5SWW7 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
C10orf55Q5SWW7 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
C10orf55Q5SWW7 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
C10orf55Q5SWW7 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
C10orf55Q5SWW7 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
C10orf55Q5SWW7 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
C10orf55Q5SWW7 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
C10orf55Q5SWW7 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
C10orf55Q5SWW7 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
C10orf55Q5SWW7 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
C10orf55Q5SWW7 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
C10orf55Q5SWW7 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
C10orf55Q5SWW7 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
C10orf55Q5SWW7 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
C10orf55Q5SWW7 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
C10orf55Q5SWW7 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
C10orf55Q5SWW7 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
C10orf55Q5SWW7 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
C10orf55Q5SWW7 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
C10orf55Q5SWW7 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
C10orf55Q5SWW7 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
C10orf55Q5SWW7 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
C10orf55Q5SWW7 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
C10orf55Q5SWW7 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
C10orf55Q5SWW7 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
C10orf55Q5SWW7 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
C10orf55Q5SWW7 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
C10orf55Q5SWW7 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
C10orf55Q5SWW7 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
C10orf55Q5SWW7 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
C10orf55Q5SWW7 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
C10orf55Q5SWW7 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
C10orf55Q5SWW7 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
C10orf55Q5SWW7 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
C10orf55Q5SWW7 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
C10orf55Q5SWW7 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
C10orf55Q5SWW7 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
C10orf55Q5SWW7 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
C10orf55Q5SWW7 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
C10orf55Q5SWW7 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
C10orf55Q5SWW7 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
C10orf55Q5SWW7 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
C10orf55Q5SWW7 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
C10orf55Q5SWW7 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
C10orf55Q5SWW7 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
C10orf55Q5SWW7 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
C10orf55Q5SWW7 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
C10orf55Q5SWW7 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
C10orf55Q5SWW7 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
C10orf55Q5SWW7 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
C10orf55Q5SWW7 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
C10orf55Q5SWW7 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
C10orf55Q5SWW7 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
C10orf55Q5SWW7 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC14.16□□□□□ -0.14
C10orf55Q5SWW7 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC14.16□□□□□ -0.14
C10orf55Q5SWW7 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.7 ms