Protein–RNA interactions for Protein: Q4KMQ1

TPRN, Taperin, humanhuman

Predictions only

Length 711 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRNQ4KMQ1 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TPRNQ4KMQ1 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TPRNQ4KMQ1 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TPRNQ4KMQ1 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
TPRNQ4KMQ1 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
TPRNQ4KMQ1 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TPRNQ4KMQ1 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TPRNQ4KMQ1 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TPRNQ4KMQ1 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TPRNQ4KMQ1 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TPRNQ4KMQ1 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TPRNQ4KMQ1 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TPRNQ4KMQ1 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TPRNQ4KMQ1 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TPRNQ4KMQ1 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TPRNQ4KMQ1 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TPRNQ4KMQ1 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TPRNQ4KMQ1 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TPRNQ4KMQ1 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TPRNQ4KMQ1 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TPRNQ4KMQ1 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TPRNQ4KMQ1 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TPRNQ4KMQ1 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TPRNQ4KMQ1 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TPRNQ4KMQ1 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
TPRNQ4KMQ1 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TPRNQ4KMQ1 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TPRNQ4KMQ1 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TPRNQ4KMQ1 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TPRNQ4KMQ1 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TPRNQ4KMQ1 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TPRNQ4KMQ1 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
TPRNQ4KMQ1 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TPRNQ4KMQ1 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
TPRNQ4KMQ1 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
TPRNQ4KMQ1 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TPRNQ4KMQ1 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TPRNQ4KMQ1 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TPRNQ4KMQ1 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TPRNQ4KMQ1 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TPRNQ4KMQ1 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TPRNQ4KMQ1 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TPRNQ4KMQ1 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TPRNQ4KMQ1 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TPRNQ4KMQ1 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TPRNQ4KMQ1 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TPRNQ4KMQ1 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
TPRNQ4KMQ1 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TPRNQ4KMQ1 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TPRNQ4KMQ1 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TPRNQ4KMQ1 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TPRNQ4KMQ1 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TPRNQ4KMQ1 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TPRNQ4KMQ1 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TPRNQ4KMQ1 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TPRNQ4KMQ1 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TPRNQ4KMQ1 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
TPRNQ4KMQ1 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TPRNQ4KMQ1 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TPRNQ4KMQ1 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TPRNQ4KMQ1 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TPRNQ4KMQ1 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TPRNQ4KMQ1 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TPRNQ4KMQ1 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TPRNQ4KMQ1 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TPRNQ4KMQ1 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TPRNQ4KMQ1 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TPRNQ4KMQ1 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
TPRNQ4KMQ1 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TPRNQ4KMQ1 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TPRNQ4KMQ1 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TPRNQ4KMQ1 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TPRNQ4KMQ1 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TPRNQ4KMQ1 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TPRNQ4KMQ1 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TPRNQ4KMQ1 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TPRNQ4KMQ1 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TPRNQ4KMQ1 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TPRNQ4KMQ1 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TPRNQ4KMQ1 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TPRNQ4KMQ1 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TPRNQ4KMQ1 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TPRNQ4KMQ1 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TPRNQ4KMQ1 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TPRNQ4KMQ1 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TPRNQ4KMQ1 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TPRNQ4KMQ1 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TPRNQ4KMQ1 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TPRNQ4KMQ1 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TPRNQ4KMQ1 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TPRNQ4KMQ1 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TPRNQ4KMQ1 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TPRNQ4KMQ1 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TPRNQ4KMQ1 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TPRNQ4KMQ1 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TPRNQ4KMQ1 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TPRNQ4KMQ1 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
TPRNQ4KMQ1 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TPRNQ4KMQ1 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TPRNQ4KMQ1 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms