Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY56

SP6, Transcription factor Sp6, humanhuman

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Length 376 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP6Q3SY56 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SP6Q3SY56 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SP6Q3SY56 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SP6Q3SY56 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SP6Q3SY56 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SP6Q3SY56 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SP6Q3SY56 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SP6Q3SY56 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SP6Q3SY56 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SP6Q3SY56 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SP6Q3SY56 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SP6Q3SY56 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SP6Q3SY56 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SP6Q3SY56 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SP6Q3SY56 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SP6Q3SY56 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SP6Q3SY56 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SP6Q3SY56 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SP6Q3SY56 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SP6Q3SY56 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SP6Q3SY56 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SP6Q3SY56 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SP6Q3SY56 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SP6Q3SY56 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SP6Q3SY56 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SP6Q3SY56 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SP6Q3SY56 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SP6Q3SY56 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SP6Q3SY56 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SP6Q3SY56 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SP6Q3SY56 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SP6Q3SY56 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SP6Q3SY56 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SP6Q3SY56 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SP6Q3SY56 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SP6Q3SY56 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SP6Q3SY56 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SP6Q3SY56 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SP6Q3SY56 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SP6Q3SY56 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SP6Q3SY56 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SP6Q3SY56 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SP6Q3SY56 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SP6Q3SY56 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SP6Q3SY56 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SP6Q3SY56 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SP6Q3SY56 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
SP6Q3SY56 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SP6Q3SY56 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SP6Q3SY56 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SP6Q3SY56 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SP6Q3SY56 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SP6Q3SY56 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SP6Q3SY56 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
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SP6Q3SY56 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SP6Q3SY56 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SP6Q3SY56 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SP6Q3SY56 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SP6Q3SY56 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SP6Q3SY56 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SP6Q3SY56 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SP6Q3SY56 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
SP6Q3SY56 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SP6Q3SY56 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SP6Q3SY56 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SP6Q3SY56 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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SP6Q3SY56 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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SP6Q3SY56 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SP6Q3SY56 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SP6Q3SY56 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SP6Q3SY56 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SP6Q3SY56 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SP6Q3SY56 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SP6Q3SY56 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SP6Q3SY56 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SP6Q3SY56 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SP6Q3SY56 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SP6Q3SY56 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SP6Q3SY56 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SP6Q3SY56 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SP6Q3SY56 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SP6Q3SY56 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SP6Q3SY56 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SP6Q3SY56 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SP6Q3SY56 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SP6Q3SY56 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
SP6Q3SY56 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SP6Q3SY56 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SP6Q3SY56 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SP6Q3SY56 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SP6Q3SY56 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SP6Q3SY56 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SP6Q3SY56 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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