Protein–RNA interactions for Protein: Q1ED39

KNOP1, Lysine-rich nucleolar protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNOP1Q1ED39 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
KNOP1Q1ED39 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
KNOP1Q1ED39 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
KNOP1Q1ED39 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
KNOP1Q1ED39 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
KNOP1Q1ED39 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
KNOP1Q1ED39 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
KNOP1Q1ED39 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
KNOP1Q1ED39 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
KNOP1Q1ED39 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
KNOP1Q1ED39 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
KNOP1Q1ED39 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
KNOP1Q1ED39 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
KNOP1Q1ED39 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
KNOP1Q1ED39 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
KNOP1Q1ED39 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
KNOP1Q1ED39 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
KNOP1Q1ED39 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
KNOP1Q1ED39 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
KNOP1Q1ED39 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
KNOP1Q1ED39 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
KNOP1Q1ED39 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
KNOP1Q1ED39 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
KNOP1Q1ED39 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
KNOP1Q1ED39 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
KNOP1Q1ED39 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
KNOP1Q1ED39 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
KNOP1Q1ED39 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
KNOP1Q1ED39 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
KNOP1Q1ED39 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
KNOP1Q1ED39 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
KNOP1Q1ED39 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
KNOP1Q1ED39 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
KNOP1Q1ED39 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
KNOP1Q1ED39 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
KNOP1Q1ED39 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
KNOP1Q1ED39 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
KNOP1Q1ED39 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
KNOP1Q1ED39 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
KNOP1Q1ED39 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
KNOP1Q1ED39 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
KNOP1Q1ED39 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
KNOP1Q1ED39 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
KNOP1Q1ED39 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
KNOP1Q1ED39 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
KNOP1Q1ED39 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
KNOP1Q1ED39 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
KNOP1Q1ED39 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
KNOP1Q1ED39 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
KNOP1Q1ED39 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
KNOP1Q1ED39 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
KNOP1Q1ED39 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
KNOP1Q1ED39 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
KNOP1Q1ED39 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
KNOP1Q1ED39 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
KNOP1Q1ED39 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
KNOP1Q1ED39 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
KNOP1Q1ED39 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
KNOP1Q1ED39 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC19.39■□□□□ 0.69
KNOP1Q1ED39 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC19.39■□□□□ 0.69
KNOP1Q1ED39 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
KNOP1Q1ED39 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
KNOP1Q1ED39 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
KNOP1Q1ED39 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
KNOP1Q1ED39 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
KNOP1Q1ED39 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
KNOP1Q1ED39 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
KNOP1Q1ED39 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
KNOP1Q1ED39 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
KNOP1Q1ED39 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
KNOP1Q1ED39 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
KNOP1Q1ED39 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
KNOP1Q1ED39 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
KNOP1Q1ED39 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
KNOP1Q1ED39 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
KNOP1Q1ED39 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
KNOP1Q1ED39 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
KNOP1Q1ED39 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
KNOP1Q1ED39 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
KNOP1Q1ED39 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
KNOP1Q1ED39 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
KNOP1Q1ED39 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
KNOP1Q1ED39 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
KNOP1Q1ED39 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
KNOP1Q1ED39 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
KNOP1Q1ED39 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
KNOP1Q1ED39 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
KNOP1Q1ED39 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
KNOP1Q1ED39 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
KNOP1Q1ED39 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
KNOP1Q1ED39 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
KNOP1Q1ED39 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
KNOP1Q1ED39 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
KNOP1Q1ED39 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
KNOP1Q1ED39 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
KNOP1Q1ED39 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
KNOP1Q1ED39 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
KNOP1Q1ED39 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
KNOP1Q1ED39 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
KNOP1Q1ED39 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
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