Protein–RNA interactions for Protein: Q16822

PCK2, Phosphoenolpyruvate carboxykinase [GTP], mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCK2Q16822 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCK2Q16822 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PCK2Q16822 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCK2Q16822 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCK2Q16822 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PCK2Q16822 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCK2Q16822 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCK2Q16822 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCK2Q16822 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCK2Q16822 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCK2Q16822 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCK2Q16822 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCK2Q16822 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCK2Q16822 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCK2Q16822 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCK2Q16822 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCK2Q16822 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCK2Q16822 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCK2Q16822 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCK2Q16822 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCK2Q16822 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCK2Q16822 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCK2Q16822 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCK2Q16822 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCK2Q16822 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCK2Q16822 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCK2Q16822 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCK2Q16822 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCK2Q16822 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCK2Q16822 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCK2Q16822 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCK2Q16822 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCK2Q16822 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCK2Q16822 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCK2Q16822 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCK2Q16822 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCK2Q16822 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCK2Q16822 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCK2Q16822 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCK2Q16822 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCK2Q16822 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCK2Q16822 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCK2Q16822 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCK2Q16822 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCK2Q16822 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCK2Q16822 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCK2Q16822 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCK2Q16822 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCK2Q16822 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCK2Q16822 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCK2Q16822 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCK2Q16822 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCK2Q16822 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCK2Q16822 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCK2Q16822 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PCK2Q16822 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCK2Q16822 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCK2Q16822 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCK2Q16822 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCK2Q16822 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCK2Q16822 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCK2Q16822 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCK2Q16822 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCK2Q16822 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCK2Q16822 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCK2Q16822 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PCK2Q16822 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCK2Q16822 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCK2Q16822 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCK2Q16822 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCK2Q16822 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCK2Q16822 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCK2Q16822 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCK2Q16822 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCK2Q16822 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCK2Q16822 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCK2Q16822 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCK2Q16822 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCK2Q16822 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCK2Q16822 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCK2Q16822 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCK2Q16822 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCK2Q16822 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCK2Q16822 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCK2Q16822 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCK2Q16822 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCK2Q16822 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCK2Q16822 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCK2Q16822 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCK2Q16822 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCK2Q16822 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCK2Q16822 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCK2Q16822 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCK2Q16822 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCK2Q16822 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCK2Q16822 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PCK2Q16822 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCK2Q16822 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCK2Q16822 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCK2Q16822 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms