Protein–RNA interactions for Protein: Q15645

TRIP13, Pachytene checkpoint protein 2 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP13Q15645 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRIP13Q15645 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRIP13Q15645 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRIP13Q15645 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRIP13Q15645 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRIP13Q15645 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRIP13Q15645 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRIP13Q15645 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
TRIP13Q15645 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRIP13Q15645 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRIP13Q15645 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRIP13Q15645 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRIP13Q15645 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
TRIP13Q15645 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRIP13Q15645 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
TRIP13Q15645 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRIP13Q15645 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
TRIP13Q15645 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRIP13Q15645 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRIP13Q15645 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRIP13Q15645 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRIP13Q15645 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
TRIP13Q15645 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRIP13Q15645 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRIP13Q15645 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRIP13Q15645 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRIP13Q15645 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRIP13Q15645 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRIP13Q15645 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRIP13Q15645 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRIP13Q15645 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRIP13Q15645 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRIP13Q15645 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRIP13Q15645 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRIP13Q15645 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRIP13Q15645 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRIP13Q15645 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRIP13Q15645 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRIP13Q15645 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRIP13Q15645 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRIP13Q15645 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRIP13Q15645 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRIP13Q15645 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRIP13Q15645 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRIP13Q15645 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRIP13Q15645 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRIP13Q15645 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRIP13Q15645 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRIP13Q15645 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRIP13Q15645 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRIP13Q15645 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRIP13Q15645 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRIP13Q15645 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRIP13Q15645 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRIP13Q15645 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRIP13Q15645 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRIP13Q15645 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TRIP13Q15645 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TRIP13Q15645 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
TRIP13Q15645 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.53
TRIP13Q15645 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TRIP13Q15645 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
TRIP13Q15645 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRIP13Q15645 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRIP13Q15645 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRIP13Q15645 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRIP13Q15645 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRIP13Q15645 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRIP13Q15645 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRIP13Q15645 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
TRIP13Q15645 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRIP13Q15645 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRIP13Q15645 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRIP13Q15645 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRIP13Q15645 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRIP13Q15645 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRIP13Q15645 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRIP13Q15645 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRIP13Q15645 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRIP13Q15645 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRIP13Q15645 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRIP13Q15645 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRIP13Q15645 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRIP13Q15645 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRIP13Q15645 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRIP13Q15645 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRIP13Q15645 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRIP13Q15645 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRIP13Q15645 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRIP13Q15645 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRIP13Q15645 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRIP13Q15645 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRIP13Q15645 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRIP13Q15645 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRIP13Q15645 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRIP13Q15645 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRIP13Q15645 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
TRIP13Q15645 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRIP13Q15645 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRIP13Q15645 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
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