Protein–RNA interactions for Protein: Q15628

TRADD, Tumor necrosis factor receptor type 1-associated DEATH domain protein, humanhuman

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Length 312 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRADDQ15628 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRADDQ15628 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRADDQ15628 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRADDQ15628 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRADDQ15628 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRADDQ15628 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRADDQ15628 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRADDQ15628 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRADDQ15628 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRADDQ15628 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRADDQ15628 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRADDQ15628 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRADDQ15628 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRADDQ15628 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRADDQ15628 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRADDQ15628 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRADDQ15628 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRADDQ15628 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRADDQ15628 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
TRADDQ15628 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRADDQ15628 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRADDQ15628 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRADDQ15628 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRADDQ15628 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRADDQ15628 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRADDQ15628 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRADDQ15628 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRADDQ15628 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRADDQ15628 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRADDQ15628 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRADDQ15628 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRADDQ15628 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRADDQ15628 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRADDQ15628 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRADDQ15628 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRADDQ15628 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRADDQ15628 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRADDQ15628 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRADDQ15628 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRADDQ15628 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRADDQ15628 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
TRADDQ15628 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
TRADDQ15628 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
TRADDQ15628 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRADDQ15628 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRADDQ15628 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRADDQ15628 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRADDQ15628 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRADDQ15628 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRADDQ15628 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRADDQ15628 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRADDQ15628 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRADDQ15628 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
TRADDQ15628 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRADDQ15628 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRADDQ15628 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRADDQ15628 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRADDQ15628 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRADDQ15628 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRADDQ15628 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRADDQ15628 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRADDQ15628 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRADDQ15628 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRADDQ15628 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRADDQ15628 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRADDQ15628 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRADDQ15628 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRADDQ15628 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRADDQ15628 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRADDQ15628 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRADDQ15628 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRADDQ15628 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRADDQ15628 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
TRADDQ15628 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRADDQ15628 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRADDQ15628 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRADDQ15628 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRADDQ15628 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRADDQ15628 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
TRADDQ15628 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRADDQ15628 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRADDQ15628 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRADDQ15628 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRADDQ15628 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
TRADDQ15628 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRADDQ15628 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRADDQ15628 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRADDQ15628 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRADDQ15628 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRADDQ15628 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
TRADDQ15628 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRADDQ15628 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRADDQ15628 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRADDQ15628 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRADDQ15628 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRADDQ15628 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRADDQ15628 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRADDQ15628 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRADDQ15628 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRADDQ15628 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms