Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

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Length 726 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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BRD3Q15059 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
BRD3Q15059 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
BRD3Q15059 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
BRD3Q15059 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
BRD3Q15059 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
BRD3Q15059 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
BRD3Q15059 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
BRD3Q15059 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
BRD3Q15059 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.59
BRD3Q15059 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
BRD3Q15059 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
BRD3Q15059 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
BRD3Q15059 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
BRD3Q15059 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
BRD3Q15059 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
BRD3Q15059 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.59
BRD3Q15059 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
BRD3Q15059 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
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BRD3Q15059 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
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BRD3Q15059 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
BRD3Q15059 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
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BRD3Q15059 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
BRD3Q15059 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
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BRD3Q15059 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
BRD3Q15059 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
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BRD3Q15059 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
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BRD3Q15059 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
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BRD3Q15059 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BRD3Q15059 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BRD3Q15059 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BRD3Q15059 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BRD3Q15059 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BRD3Q15059 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BRD3Q15059 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BRD3Q15059 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BRD3Q15059 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BRD3Q15059 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BRD3Q15059 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
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