Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SMCO1Q147U7 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SMCO1Q147U7 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SMCO1Q147U7 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SMCO1Q147U7 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SMCO1Q147U7 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SMCO1Q147U7 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SMCO1Q147U7 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SMCO1Q147U7 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SMCO1Q147U7 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SMCO1Q147U7 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
SMCO1Q147U7 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SMCO1Q147U7 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SMCO1Q147U7 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SMCO1Q147U7 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SMCO1Q147U7 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SMCO1Q147U7 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SMCO1Q147U7 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SMCO1Q147U7 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SMCO1Q147U7 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SMCO1Q147U7 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
SMCO1Q147U7 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SMCO1Q147U7 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SMCO1Q147U7 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SMCO1Q147U7 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SMCO1Q147U7 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SMCO1Q147U7 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SMCO1Q147U7 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SMCO1Q147U7 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SMCO1Q147U7 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SMCO1Q147U7 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SMCO1Q147U7 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SMCO1Q147U7 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SMCO1Q147U7 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SMCO1Q147U7 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SMCO1Q147U7 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SMCO1Q147U7 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SMCO1Q147U7 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SMCO1Q147U7 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SMCO1Q147U7 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SMCO1Q147U7 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
SMCO1Q147U7 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SMCO1Q147U7 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SMCO1Q147U7 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SMCO1Q147U7 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SMCO1Q147U7 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SMCO1Q147U7 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SMCO1Q147U7 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SMCO1Q147U7 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SMCO1Q147U7 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SMCO1Q147U7 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SMCO1Q147U7 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SMCO1Q147U7 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SMCO1Q147U7 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SMCO1Q147U7 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SMCO1Q147U7 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SMCO1Q147U7 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SMCO1Q147U7 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SMCO1Q147U7 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SMCO1Q147U7 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SMCO1Q147U7 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SMCO1Q147U7 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SMCO1Q147U7 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SMCO1Q147U7 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SMCO1Q147U7 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SMCO1Q147U7 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SMCO1Q147U7 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SMCO1Q147U7 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SMCO1Q147U7 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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SMCO1Q147U7 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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SMCO1Q147U7 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SMCO1Q147U7 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SMCO1Q147U7 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
SMCO1Q147U7 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SMCO1Q147U7 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SMCO1Q147U7 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SMCO1Q147U7 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SMCO1Q147U7 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SMCO1Q147U7 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SMCO1Q147U7 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SMCO1Q147U7 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SMCO1Q147U7 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SMCO1Q147U7 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SMCO1Q147U7 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SMCO1Q147U7 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SMCO1Q147U7 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SMCO1Q147U7 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
SMCO1Q147U7 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SMCO1Q147U7 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SMCO1Q147U7 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SMCO1Q147U7 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SMCO1Q147U7 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SMCO1Q147U7 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SMCO1Q147U7 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SMCO1Q147U7 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SMCO1Q147U7 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SMCO1Q147U7 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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