Protein–RNA interactions for Protein: Q14406

CSHL1, Chorionic somatomammotropin hormone-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSHL1Q14406 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CSHL1Q14406 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CSHL1Q14406 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CSHL1Q14406 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CSHL1Q14406 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CSHL1Q14406 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CSHL1Q14406 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CSHL1Q14406 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CSHL1Q14406 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CSHL1Q14406 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CSHL1Q14406 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CSHL1Q14406 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CSHL1Q14406 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CSHL1Q14406 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CSHL1Q14406 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CSHL1Q14406 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CSHL1Q14406 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CSHL1Q14406 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CSHL1Q14406 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CSHL1Q14406 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CSHL1Q14406 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CSHL1Q14406 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CSHL1Q14406 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CSHL1Q14406 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CSHL1Q14406 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CSHL1Q14406 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CSHL1Q14406 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CSHL1Q14406 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CSHL1Q14406 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CSHL1Q14406 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CSHL1Q14406 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CSHL1Q14406 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CSHL1Q14406 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CSHL1Q14406 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CSHL1Q14406 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CSHL1Q14406 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CSHL1Q14406 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CSHL1Q14406 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CSHL1Q14406 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CSHL1Q14406 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CSHL1Q14406 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CSHL1Q14406 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CSHL1Q14406 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CSHL1Q14406 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CSHL1Q14406 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CSHL1Q14406 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CSHL1Q14406 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CSHL1Q14406 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CSHL1Q14406 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CSHL1Q14406 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CSHL1Q14406 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CSHL1Q14406 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CSHL1Q14406 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CSHL1Q14406 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CSHL1Q14406 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CSHL1Q14406 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CSHL1Q14406 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CSHL1Q14406 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CSHL1Q14406 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CSHL1Q14406 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CSHL1Q14406 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CSHL1Q14406 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CSHL1Q14406 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CSHL1Q14406 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CSHL1Q14406 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CSHL1Q14406 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CSHL1Q14406 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CSHL1Q14406 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CSHL1Q14406 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CSHL1Q14406 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CSHL1Q14406 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CSHL1Q14406 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CSHL1Q14406 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CSHL1Q14406 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CSHL1Q14406 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CSHL1Q14406 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CSHL1Q14406 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CSHL1Q14406 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CSHL1Q14406 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CSHL1Q14406 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CSHL1Q14406 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CSHL1Q14406 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CSHL1Q14406 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CSHL1Q14406 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CSHL1Q14406 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CSHL1Q14406 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CSHL1Q14406 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CSHL1Q14406 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CSHL1Q14406 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CSHL1Q14406 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CSHL1Q14406 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CSHL1Q14406 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CSHL1Q14406 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CSHL1Q14406 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CSHL1Q14406 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CSHL1Q14406 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CSHL1Q14406 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CSHL1Q14406 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CSHL1Q14406 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CSHL1Q14406 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
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