Protein–RNA interactions for Protein: Q14123

PDE1C, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 709 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE1CQ14123 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDE1CQ14123 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDE1CQ14123 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDE1CQ14123 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDE1CQ14123 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDE1CQ14123 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDE1CQ14123 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PDE1CQ14123 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDE1CQ14123 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDE1CQ14123 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDE1CQ14123 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDE1CQ14123 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDE1CQ14123 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDE1CQ14123 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDE1CQ14123 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDE1CQ14123 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDE1CQ14123 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDE1CQ14123 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDE1CQ14123 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDE1CQ14123 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDE1CQ14123 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDE1CQ14123 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDE1CQ14123 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDE1CQ14123 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDE1CQ14123 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDE1CQ14123 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDE1CQ14123 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDE1CQ14123 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDE1CQ14123 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDE1CQ14123 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDE1CQ14123 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDE1CQ14123 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDE1CQ14123 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDE1CQ14123 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDE1CQ14123 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDE1CQ14123 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDE1CQ14123 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDE1CQ14123 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDE1CQ14123 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDE1CQ14123 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDE1CQ14123 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDE1CQ14123 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDE1CQ14123 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDE1CQ14123 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDE1CQ14123 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDE1CQ14123 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDE1CQ14123 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDE1CQ14123 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDE1CQ14123 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDE1CQ14123 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDE1CQ14123 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDE1CQ14123 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDE1CQ14123 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDE1CQ14123 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDE1CQ14123 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDE1CQ14123 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDE1CQ14123 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PDE1CQ14123 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDE1CQ14123 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDE1CQ14123 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDE1CQ14123 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PDE1CQ14123 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDE1CQ14123 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDE1CQ14123 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDE1CQ14123 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDE1CQ14123 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PDE1CQ14123 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDE1CQ14123 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDE1CQ14123 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDE1CQ14123 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDE1CQ14123 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDE1CQ14123 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDE1CQ14123 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDE1CQ14123 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDE1CQ14123 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDE1CQ14123 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDE1CQ14123 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDE1CQ14123 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PDE1CQ14123 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PDE1CQ14123 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PDE1CQ14123 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PDE1CQ14123 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PDE1CQ14123 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PDE1CQ14123 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PDE1CQ14123 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PDE1CQ14123 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PDE1CQ14123 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PDE1CQ14123 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PDE1CQ14123 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PDE1CQ14123 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PDE1CQ14123 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PDE1CQ14123 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PDE1CQ14123 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PDE1CQ14123 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PDE1CQ14123 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PDE1CQ14123 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PDE1CQ14123 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PDE1CQ14123 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PDE1CQ14123 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PDE1CQ14123 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
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