Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Length 790 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDH18Q13634 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDH18Q13634 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDH18Q13634 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDH18Q13634 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDH18Q13634 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDH18Q13634 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDH18Q13634 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDH18Q13634 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDH18Q13634 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDH18Q13634 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDH18Q13634 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDH18Q13634 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDH18Q13634 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDH18Q13634 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDH18Q13634 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDH18Q13634 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDH18Q13634 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDH18Q13634 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDH18Q13634 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDH18Q13634 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDH18Q13634 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDH18Q13634 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDH18Q13634 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDH18Q13634 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDH18Q13634 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDH18Q13634 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDH18Q13634 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDH18Q13634 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDH18Q13634 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CDH18Q13634 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDH18Q13634 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDH18Q13634 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDH18Q13634 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDH18Q13634 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
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CDH18Q13634 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDH18Q13634 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDH18Q13634 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
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CDH18Q13634 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
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CDH18Q13634 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDH18Q13634 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
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CDH18Q13634 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDH18Q13634 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDH18Q13634 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDH18Q13634 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDH18Q13634 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDH18Q13634 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDH18Q13634 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
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CDH18Q13634 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDH18Q13634 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
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CDH18Q13634 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDH18Q13634 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
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CDH18Q13634 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDH18Q13634 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDH18Q13634 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDH18Q13634 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDH18Q13634 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDH18Q13634 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDH18Q13634 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDH18Q13634 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDH18Q13634 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDH18Q13634 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CDH18Q13634 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDH18Q13634 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDH18Q13634 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDH18Q13634 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDH18Q13634 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDH18Q13634 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDH18Q13634 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDH18Q13634 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDH18Q13634 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
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