Protein–RNA interactions for Protein: Q13615

MTMR3, Myotubularin-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR3Q13615 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
MTMR3Q13615 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
MTMR3Q13615 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
MTMR3Q13615 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
MTMR3Q13615 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
MTMR3Q13615 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
MTMR3Q13615 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
MTMR3Q13615 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
MTMR3Q13615 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
MTMR3Q13615 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
MTMR3Q13615 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
MTMR3Q13615 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
MTMR3Q13615 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
MTMR3Q13615 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
MTMR3Q13615 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
MTMR3Q13615 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
MTMR3Q13615 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
MTMR3Q13615 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
MTMR3Q13615 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
MTMR3Q13615 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
MTMR3Q13615 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
MTMR3Q13615 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
MTMR3Q13615 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
MTMR3Q13615 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
MTMR3Q13615 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
MTMR3Q13615 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
MTMR3Q13615 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
MTMR3Q13615 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
MTMR3Q13615 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
MTMR3Q13615 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
MTMR3Q13615 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
MTMR3Q13615 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
MTMR3Q13615 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
MTMR3Q13615 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
MTMR3Q13615 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
MTMR3Q13615 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
MTMR3Q13615 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
MTMR3Q13615 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
MTMR3Q13615 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
MTMR3Q13615 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
MTMR3Q13615 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
MTMR3Q13615 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
MTMR3Q13615 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
MTMR3Q13615 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
MTMR3Q13615 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
MTMR3Q13615 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
MTMR3Q13615 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
MTMR3Q13615 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
MTMR3Q13615 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
MTMR3Q13615 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
MTMR3Q13615 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
MTMR3Q13615 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
MTMR3Q13615 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
MTMR3Q13615 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
MTMR3Q13615 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
MTMR3Q13615 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
MTMR3Q13615 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
MTMR3Q13615 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
MTMR3Q13615 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
MTMR3Q13615 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
MTMR3Q13615 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
MTMR3Q13615 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
MTMR3Q13615 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
MTMR3Q13615 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
MTMR3Q13615 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
MTMR3Q13615 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
MTMR3Q13615 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
MTMR3Q13615 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
MTMR3Q13615 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
MTMR3Q13615 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
MTMR3Q13615 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
MTMR3Q13615 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
MTMR3Q13615 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
MTMR3Q13615 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
MTMR3Q13615 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
MTMR3Q13615 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
MTMR3Q13615 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
MTMR3Q13615 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
MTMR3Q13615 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
MTMR3Q13615 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
MTMR3Q13615 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
MTMR3Q13615 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
MTMR3Q13615 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
MTMR3Q13615 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
MTMR3Q13615 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
MTMR3Q13615 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC19.27■□□□□ 0.67
MTMR3Q13615 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
MTMR3Q13615 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
MTMR3Q13615 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
MTMR3Q13615 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
MTMR3Q13615 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
MTMR3Q13615 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
MTMR3Q13615 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
MTMR3Q13615 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
MTMR3Q13615 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC19.26■□□□□ 0.67
MTMR3Q13615 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
MTMR3Q13615 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
MTMR3Q13615 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
MTMR3Q13615 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
MTMR3Q13615 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms