Protein–RNA interactions for Protein: Q13563

PKD2, Polycystin-2, humanhuman

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Length 968 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD2Q13563 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PKD2Q13563 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PKD2Q13563 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
PKD2Q13563 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PKD2Q13563 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PKD2Q13563 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PKD2Q13563 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
PKD2Q13563 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
PKD2Q13563 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC25.95■■□□□ 1.75
PKD2Q13563 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
PKD2Q13563 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PKD2Q13563 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PKD2Q13563 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PKD2Q13563 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PKD2Q13563 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
PKD2Q13563 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PKD2Q13563 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PKD2Q13563 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PKD2Q13563 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
PKD2Q13563 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
PKD2Q13563 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PKD2Q13563 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PKD2Q13563 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PKD2Q13563 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PKD2Q13563 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
PKD2Q13563 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PKD2Q13563 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PKD2Q13563 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PKD2Q13563 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PKD2Q13563 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PKD2Q13563 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PKD2Q13563 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PKD2Q13563 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PKD2Q13563 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PKD2Q13563 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PKD2Q13563 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PKD2Q13563 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
PKD2Q13563 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PKD2Q13563 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PKD2Q13563 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PKD2Q13563 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PKD2Q13563 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PKD2Q13563 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PKD2Q13563 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PKD2Q13563 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PKD2Q13563 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PKD2Q13563 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PKD2Q13563 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PKD2Q13563 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
PKD2Q13563 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
PKD2Q13563 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PKD2Q13563 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
PKD2Q13563 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PKD2Q13563 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PKD2Q13563 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PKD2Q13563 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PKD2Q13563 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PKD2Q13563 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PKD2Q13563 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PKD2Q13563 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PKD2Q13563 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PKD2Q13563 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
PKD2Q13563 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
PKD2Q13563 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PKD2Q13563 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PKD2Q13563 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PKD2Q13563 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PKD2Q13563 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PKD2Q13563 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PKD2Q13563 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PKD2Q13563 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PKD2Q13563 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PKD2Q13563 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PKD2Q13563 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PKD2Q13563 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PKD2Q13563 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PKD2Q13563 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PKD2Q13563 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PKD2Q13563 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
PKD2Q13563 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
PKD2Q13563 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
PKD2Q13563 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
PKD2Q13563 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PKD2Q13563 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PKD2Q13563 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PKD2Q13563 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PKD2Q13563 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PKD2Q13563 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PKD2Q13563 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PKD2Q13563 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PKD2Q13563 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PKD2Q13563 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PKD2Q13563 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PKD2Q13563 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PKD2Q13563 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
PKD2Q13563 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PKD2Q13563 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PKD2Q13563 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PKD2Q13563 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PKD2Q13563 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
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