Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

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Length 867 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SP140Q13342 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SP140Q13342 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SP140Q13342 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SP140Q13342 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SP140Q13342 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SP140Q13342 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SP140Q13342 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SP140Q13342 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SP140Q13342 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SP140Q13342 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
SP140Q13342 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
SP140Q13342 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SP140Q13342 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
SP140Q13342 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
SP140Q13342 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SP140Q13342 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SP140Q13342 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SP140Q13342 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SP140Q13342 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SP140Q13342 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SP140Q13342 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SP140Q13342 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SP140Q13342 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SP140Q13342 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SP140Q13342 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SP140Q13342 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SP140Q13342 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SP140Q13342 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SP140Q13342 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SP140Q13342 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SP140Q13342 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SP140Q13342 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SP140Q13342 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SP140Q13342 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SP140Q13342 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SP140Q13342 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SP140Q13342 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
SP140Q13342 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
SP140Q13342 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SP140Q13342 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SP140Q13342 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SP140Q13342 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SP140Q13342 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
SP140Q13342 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SP140Q13342 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SP140Q13342 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SP140Q13342 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
SP140Q13342 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
SP140Q13342 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SP140Q13342 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SP140Q13342 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SP140Q13342 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SP140Q13342 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SP140Q13342 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SP140Q13342 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SP140Q13342 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
SP140Q13342 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SP140Q13342 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SP140Q13342 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SP140Q13342 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SP140Q13342 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SP140Q13342 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SP140Q13342 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SP140Q13342 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SP140Q13342 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SP140Q13342 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SP140Q13342 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SP140Q13342 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SP140Q13342 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SP140Q13342 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SP140Q13342 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
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SP140Q13342 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SP140Q13342 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SP140Q13342 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
SP140Q13342 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SP140Q13342 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SP140Q13342 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SP140Q13342 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SP140Q13342 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
SP140Q13342 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SP140Q13342 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SP140Q13342 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SP140Q13342 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SP140Q13342 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SP140Q13342 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SP140Q13342 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SP140Q13342 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SP140Q13342 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SP140Q13342 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SP140Q13342 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SP140Q13342 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SP140Q13342 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SP140Q13342 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SP140Q13342 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SP140Q13342 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SP140Q13342 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SP140Q13342 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SP140Q13342 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
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