Protein–RNA interactions for Protein: Q13278

RIG, Putative protein RIG, humanhuman

Predictions only

Length 110 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIGQ13278 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RIGQ13278 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RIGQ13278 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RIGQ13278 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
RIGQ13278 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
RIGQ13278 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
RIGQ13278 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RIGQ13278 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
RIGQ13278 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.24□□□□□ -0.29
RIGQ13278 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
RIGQ13278 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RIGQ13278 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
RIGQ13278 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RIGQ13278 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
RIGQ13278 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RIGQ13278 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RIGQ13278 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RIGQ13278 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
RIGQ13278 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RIGQ13278 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
RIGQ13278 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
RIGQ13278 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
RIGQ13278 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RIGQ13278 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
RIGQ13278 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
RIGQ13278 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
RIGQ13278 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RIGQ13278 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RIGQ13278 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RIGQ13278 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
RIGQ13278 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
RIGQ13278 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RIGQ13278 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
RIGQ13278 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RIGQ13278 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
RIGQ13278 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
RIGQ13278 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
RIGQ13278 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
RIGQ13278 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
RIGQ13278 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RIGQ13278 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RIGQ13278 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
RIGQ13278 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
RIGQ13278 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
RIGQ13278 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RIGQ13278 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RIGQ13278 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RIGQ13278 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RIGQ13278 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RIGQ13278 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RIGQ13278 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RIGQ13278 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RIGQ13278 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RIGQ13278 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RIGQ13278 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RIGQ13278 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RIGQ13278 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RIGQ13278 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RIGQ13278 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RIGQ13278 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RIGQ13278 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RIGQ13278 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RIGQ13278 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RIGQ13278 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RIGQ13278 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RIGQ13278 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RIGQ13278 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RIGQ13278 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RIGQ13278 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RIGQ13278 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RIGQ13278 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
RIGQ13278 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
RIGQ13278 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RIGQ13278 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RIGQ13278 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RIGQ13278 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
RIGQ13278 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
RIGQ13278 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RIGQ13278 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RIGQ13278 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RIGQ13278 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RIGQ13278 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RIGQ13278 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RIGQ13278 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RIGQ13278 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RIGQ13278 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RIGQ13278 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RIGQ13278 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RIGQ13278 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RIGQ13278 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RIGQ13278 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RIGQ13278 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RIGQ13278 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RIGQ13278 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RIGQ13278 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RIGQ13278 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RIGQ13278 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
RIGQ13278 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RIGQ13278 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RIGQ13278 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms