Protein–RNA interactions for Protein: Q13216

ERCC8, DNA excision repair protein ERCC-8, humanhuman

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC8Q13216 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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ERCC8Q13216 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ERCC8Q13216 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ERCC8Q13216 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ERCC8Q13216 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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ERCC8Q13216 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
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ERCC8Q13216 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
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ERCC8Q13216 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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ERCC8Q13216 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
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ERCC8Q13216 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ERCC8Q13216 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ERCC8Q13216 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ERCC8Q13216 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ERCC8Q13216 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
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