Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DUSP4Q13115 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DUSP4Q13115 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
DUSP4Q13115 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DUSP4Q13115 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DUSP4Q13115 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DUSP4Q13115 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DUSP4Q13115 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DUSP4Q13115 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DUSP4Q13115 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
DUSP4Q13115 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DUSP4Q13115 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DUSP4Q13115 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DUSP4Q13115 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
DUSP4Q13115 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DUSP4Q13115 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
DUSP4Q13115 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
DUSP4Q13115 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
DUSP4Q13115 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
DUSP4Q13115 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
DUSP4Q13115 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
DUSP4Q13115 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DUSP4Q13115 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
DUSP4Q13115 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
DUSP4Q13115 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
DUSP4Q13115 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
DUSP4Q13115 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
DUSP4Q13115 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DUSP4Q13115 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
DUSP4Q13115 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DUSP4Q13115 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
DUSP4Q13115 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DUSP4Q13115 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
DUSP4Q13115 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
DUSP4Q13115 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
DUSP4Q13115 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
DUSP4Q13115 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
DUSP4Q13115 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
DUSP4Q13115 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
DUSP4Q13115 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
DUSP4Q13115 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
DUSP4Q13115 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DUSP4Q13115 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DUSP4Q13115 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DUSP4Q13115 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DUSP4Q13115 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DUSP4Q13115 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DUSP4Q13115 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DUSP4Q13115 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DUSP4Q13115 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DUSP4Q13115 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DUSP4Q13115 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DUSP4Q13115 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DUSP4Q13115 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DUSP4Q13115 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DUSP4Q13115 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DUSP4Q13115 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DUSP4Q13115 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DUSP4Q13115 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DUSP4Q13115 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DUSP4Q13115 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DUSP4Q13115 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
DUSP4Q13115 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
DUSP4Q13115 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
DUSP4Q13115 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DUSP4Q13115 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DUSP4Q13115 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
DUSP4Q13115 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DUSP4Q13115 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
DUSP4Q13115 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DUSP4Q13115 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DUSP4Q13115 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
DUSP4Q13115 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
DUSP4Q13115 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DUSP4Q13115 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DUSP4Q13115 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DUSP4Q13115 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DUSP4Q13115 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DUSP4Q13115 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DUSP4Q13115 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DUSP4Q13115 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DUSP4Q13115 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
DUSP4Q13115 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DUSP4Q13115 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DUSP4Q13115 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DUSP4Q13115 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DUSP4Q13115 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DUSP4Q13115 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DUSP4Q13115 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DUSP4Q13115 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DUSP4Q13115 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DUSP4Q13115 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DUSP4Q13115 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DUSP4Q13115 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DUSP4Q13115 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DUSP4Q13115 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DUSP4Q13115 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DUSP4Q13115 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DUSP4Q13115 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DUSP4Q13115 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
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