Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAM2

RASGEF1B, Ras-GEF domain-containing family member 1B, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGEF1BQ0VAM2 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RASGEF1BQ0VAM2 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RASGEF1BQ0VAM2 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RASGEF1BQ0VAM2 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RASGEF1BQ0VAM2 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
RASGEF1BQ0VAM2 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RASGEF1BQ0VAM2 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RASGEF1BQ0VAM2 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RASGEF1BQ0VAM2 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RASGEF1BQ0VAM2 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RASGEF1BQ0VAM2 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RASGEF1BQ0VAM2 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RASGEF1BQ0VAM2 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RASGEF1BQ0VAM2 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
RASGEF1BQ0VAM2 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RASGEF1BQ0VAM2 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
RASGEF1BQ0VAM2 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RASGEF1BQ0VAM2 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RASGEF1BQ0VAM2 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RASGEF1BQ0VAM2 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RASGEF1BQ0VAM2 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RASGEF1BQ0VAM2 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RASGEF1BQ0VAM2 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RASGEF1BQ0VAM2 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RASGEF1BQ0VAM2 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RASGEF1BQ0VAM2 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RASGEF1BQ0VAM2 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RASGEF1BQ0VAM2 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RASGEF1BQ0VAM2 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RASGEF1BQ0VAM2 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RASGEF1BQ0VAM2 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RASGEF1BQ0VAM2 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RASGEF1BQ0VAM2 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RASGEF1BQ0VAM2 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RASGEF1BQ0VAM2 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RASGEF1BQ0VAM2 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RASGEF1BQ0VAM2 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RASGEF1BQ0VAM2 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RASGEF1BQ0VAM2 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RASGEF1BQ0VAM2 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RASGEF1BQ0VAM2 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RASGEF1BQ0VAM2 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RASGEF1BQ0VAM2 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RASGEF1BQ0VAM2 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RASGEF1BQ0VAM2 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RASGEF1BQ0VAM2 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RASGEF1BQ0VAM2 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RASGEF1BQ0VAM2 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
RASGEF1BQ0VAM2 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RASGEF1BQ0VAM2 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RASGEF1BQ0VAM2 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
RASGEF1BQ0VAM2 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RASGEF1BQ0VAM2 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RASGEF1BQ0VAM2 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RASGEF1BQ0VAM2 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RASGEF1BQ0VAM2 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RASGEF1BQ0VAM2 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RASGEF1BQ0VAM2 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RASGEF1BQ0VAM2 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RASGEF1BQ0VAM2 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RASGEF1BQ0VAM2 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RASGEF1BQ0VAM2 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RASGEF1BQ0VAM2 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RASGEF1BQ0VAM2 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RASGEF1BQ0VAM2 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RASGEF1BQ0VAM2 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RASGEF1BQ0VAM2 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RASGEF1BQ0VAM2 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RASGEF1BQ0VAM2 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RASGEF1BQ0VAM2 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RASGEF1BQ0VAM2 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RASGEF1BQ0VAM2 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RASGEF1BQ0VAM2 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RASGEF1BQ0VAM2 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RASGEF1BQ0VAM2 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RASGEF1BQ0VAM2 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RASGEF1BQ0VAM2 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RASGEF1BQ0VAM2 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RASGEF1BQ0VAM2 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RASGEF1BQ0VAM2 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RASGEF1BQ0VAM2 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RASGEF1BQ0VAM2 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RASGEF1BQ0VAM2 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RASGEF1BQ0VAM2 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RASGEF1BQ0VAM2 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RASGEF1BQ0VAM2 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RASGEF1BQ0VAM2 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RASGEF1BQ0VAM2 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RASGEF1BQ0VAM2 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RASGEF1BQ0VAM2 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RASGEF1BQ0VAM2 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RASGEF1BQ0VAM2 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RASGEF1BQ0VAM2 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RASGEF1BQ0VAM2 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RASGEF1BQ0VAM2 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RASGEF1BQ0VAM2 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RASGEF1BQ0VAM2 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RASGEF1BQ0VAM2 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RASGEF1BQ0VAM2 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
RASGEF1BQ0VAM2 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms