Protein–RNA interactions for Protein: Q06265

EXOSC9, Exosome complex component RRP45, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC9Q06265 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EXOSC9Q06265 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EXOSC9Q06265 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EXOSC9Q06265 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EXOSC9Q06265 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
EXOSC9Q06265 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EXOSC9Q06265 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EXOSC9Q06265 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EXOSC9Q06265 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EXOSC9Q06265 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EXOSC9Q06265 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EXOSC9Q06265 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EXOSC9Q06265 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
EXOSC9Q06265 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EXOSC9Q06265 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EXOSC9Q06265 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EXOSC9Q06265 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EXOSC9Q06265 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EXOSC9Q06265 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EXOSC9Q06265 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EXOSC9Q06265 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EXOSC9Q06265 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EXOSC9Q06265 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EXOSC9Q06265 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EXOSC9Q06265 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EXOSC9Q06265 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
EXOSC9Q06265 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EXOSC9Q06265 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
EXOSC9Q06265 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EXOSC9Q06265 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EXOSC9Q06265 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EXOSC9Q06265 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EXOSC9Q06265 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EXOSC9Q06265 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EXOSC9Q06265 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
EXOSC9Q06265 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EXOSC9Q06265 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EXOSC9Q06265 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EXOSC9Q06265 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
EXOSC9Q06265 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
EXOSC9Q06265 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EXOSC9Q06265 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
EXOSC9Q06265 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
EXOSC9Q06265 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
EXOSC9Q06265 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
EXOSC9Q06265 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
EXOSC9Q06265 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
EXOSC9Q06265 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
EXOSC9Q06265 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EXOSC9Q06265 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EXOSC9Q06265 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EXOSC9Q06265 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
EXOSC9Q06265 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
EXOSC9Q06265 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
EXOSC9Q06265 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
EXOSC9Q06265 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EXOSC9Q06265 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EXOSC9Q06265 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EXOSC9Q06265 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EXOSC9Q06265 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EXOSC9Q06265 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EXOSC9Q06265 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EXOSC9Q06265 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EXOSC9Q06265 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EXOSC9Q06265 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
EXOSC9Q06265 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EXOSC9Q06265 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EXOSC9Q06265 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
EXOSC9Q06265 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EXOSC9Q06265 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EXOSC9Q06265 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EXOSC9Q06265 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EXOSC9Q06265 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EXOSC9Q06265 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EXOSC9Q06265 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EXOSC9Q06265 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EXOSC9Q06265 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EXOSC9Q06265 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EXOSC9Q06265 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EXOSC9Q06265 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EXOSC9Q06265 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
EXOSC9Q06265 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EXOSC9Q06265 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EXOSC9Q06265 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EXOSC9Q06265 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EXOSC9Q06265 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EXOSC9Q06265 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EXOSC9Q06265 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EXOSC9Q06265 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
EXOSC9Q06265 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EXOSC9Q06265 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EXOSC9Q06265 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
EXOSC9Q06265 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EXOSC9Q06265 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EXOSC9Q06265 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EXOSC9Q06265 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EXOSC9Q06265 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EXOSC9Q06265 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EXOSC9Q06265 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EXOSC9Q06265 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms