Protein–RNA interactions for Protein: Q05901

CHRNB3, Neuronal acetylcholine receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB3Q05901 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHRNB3Q05901 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHRNB3Q05901 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHRNB3Q05901 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHRNB3Q05901 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CHRNB3Q05901 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHRNB3Q05901 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CHRNB3Q05901 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHRNB3Q05901 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHRNB3Q05901 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHRNB3Q05901 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHRNB3Q05901 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHRNB3Q05901 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHRNB3Q05901 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHRNB3Q05901 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHRNB3Q05901 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHRNB3Q05901 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHRNB3Q05901 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHRNB3Q05901 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHRNB3Q05901 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHRNB3Q05901 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHRNB3Q05901 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHRNB3Q05901 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHRNB3Q05901 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CHRNB3Q05901 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CHRNB3Q05901 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CHRNB3Q05901 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CHRNB3Q05901 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CHRNB3Q05901 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CHRNB3Q05901 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CHRNB3Q05901 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CHRNB3Q05901 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CHRNB3Q05901 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CHRNB3Q05901 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CHRNB3Q05901 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CHRNB3Q05901 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CHRNB3Q05901 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CHRNB3Q05901 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CHRNB3Q05901 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CHRNB3Q05901 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CHRNB3Q05901 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CHRNB3Q05901 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CHRNB3Q05901 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CHRNB3Q05901 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CHRNB3Q05901 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CHRNB3Q05901 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CHRNB3Q05901 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CHRNB3Q05901 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CHRNB3Q05901 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CHRNB3Q05901 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CHRNB3Q05901 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CHRNB3Q05901 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CHRNB3Q05901 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CHRNB3Q05901 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CHRNB3Q05901 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CHRNB3Q05901 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CHRNB3Q05901 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CHRNB3Q05901 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CHRNB3Q05901 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CHRNB3Q05901 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CHRNB3Q05901 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CHRNB3Q05901 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CHRNB3Q05901 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CHRNB3Q05901 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CHRNB3Q05901 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CHRNB3Q05901 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CHRNB3Q05901 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CHRNB3Q05901 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CHRNB3Q05901 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CHRNB3Q05901 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CHRNB3Q05901 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CHRNB3Q05901 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CHRNB3Q05901 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CHRNB3Q05901 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CHRNB3Q05901 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CHRNB3Q05901 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CHRNB3Q05901 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CHRNB3Q05901 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CHRNB3Q05901 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CHRNB3Q05901 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CHRNB3Q05901 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CHRNB3Q05901 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CHRNB3Q05901 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CHRNB3Q05901 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CHRNB3Q05901 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CHRNB3Q05901 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CHRNB3Q05901 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CHRNB3Q05901 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CHRNB3Q05901 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CHRNB3Q05901 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CHRNB3Q05901 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CHRNB3Q05901 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CHRNB3Q05901 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CHRNB3Q05901 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CHRNB3Q05901 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CHRNB3Q05901 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CHRNB3Q05901 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CHRNB3Q05901 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CHRNB3Q05901 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CHRNB3Q05901 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms