Protein–RNA interactions for Protein: Q02577

NHLH2, Helix-loop-helix protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLH2Q02577 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC14.4□□□□□ -0.1
NHLH2Q02577 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
NHLH2Q02577 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC14.4□□□□□ -0.1
NHLH2Q02577 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
NHLH2Q02577 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
NHLH2Q02577 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
NHLH2Q02577 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
NHLH2Q02577 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
NHLH2Q02577 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
NHLH2Q02577 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
NHLH2Q02577 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
NHLH2Q02577 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
NHLH2Q02577 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
NHLH2Q02577 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
NHLH2Q02577 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
NHLH2Q02577 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
NHLH2Q02577 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.11
NHLH2Q02577 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.11
NHLH2Q02577 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
NHLH2Q02577 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
NHLH2Q02577 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
NHLH2Q02577 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
NHLH2Q02577 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
NHLH2Q02577 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
NHLH2Q02577 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
NHLH2Q02577 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
NHLH2Q02577 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC14.39□□□□□ -0.11
NHLH2Q02577 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
NHLH2Q02577 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
NHLH2Q02577 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
NHLH2Q02577 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
NHLH2Q02577 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
NHLH2Q02577 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
NHLH2Q02577 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
NHLH2Q02577 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
NHLH2Q02577 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
NHLH2Q02577 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
NHLH2Q02577 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
NHLH2Q02577 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
NHLH2Q02577 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
NHLH2Q02577 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
NHLH2Q02577 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC14.39□□□□□ -0.11
NHLH2Q02577 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
NHLH2Q02577 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
NHLH2Q02577 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
NHLH2Q02577 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
NHLH2Q02577 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
NHLH2Q02577 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
NHLH2Q02577 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
NHLH2Q02577 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
NHLH2Q02577 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
NHLH2Q02577 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
NHLH2Q02577 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
NHLH2Q02577 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
NHLH2Q02577 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC14.39□□□□□ -0.11
NHLH2Q02577 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
NHLH2Q02577 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
NHLH2Q02577 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
NHLH2Q02577 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
NHLH2Q02577 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
NHLH2Q02577 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
NHLH2Q02577 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
NHLH2Q02577 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
NHLH2Q02577 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
NHLH2Q02577 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
NHLH2Q02577 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
NHLH2Q02577 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
NHLH2Q02577 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
NHLH2Q02577 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
NHLH2Q02577 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
NHLH2Q02577 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
NHLH2Q02577 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
NHLH2Q02577 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
NHLH2Q02577 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
NHLH2Q02577 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
NHLH2Q02577 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
NHLH2Q02577 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
NHLH2Q02577 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
NHLH2Q02577 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
NHLH2Q02577 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
NHLH2Q02577 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
NHLH2Q02577 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
NHLH2Q02577 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
NHLH2Q02577 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
NHLH2Q02577 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
NHLH2Q02577 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
NHLH2Q02577 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
NHLH2Q02577 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
NHLH2Q02577 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
NHLH2Q02577 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
NHLH2Q02577 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
NHLH2Q02577 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC14.38□□□□□ -0.11
NHLH2Q02577 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
NHLH2Q02577 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
NHLH2Q02577 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
NHLH2Q02577 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
NHLH2Q02577 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
NHLH2Q02577 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
NHLH2Q02577 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
NHLH2Q02577 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.8 ms