Protein–RNA interactions for Protein: Q00587

CDC42EP1, Cdc42 effector protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP1Q00587 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CDC42EP1Q00587 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CDC42EP1Q00587 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CDC42EP1Q00587 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CDC42EP1Q00587 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CDC42EP1Q00587 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CDC42EP1Q00587 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CDC42EP1Q00587 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CDC42EP1Q00587 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CDC42EP1Q00587 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CDC42EP1Q00587 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
CDC42EP1Q00587 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CDC42EP1Q00587 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
CDC42EP1Q00587 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CDC42EP1Q00587 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CDC42EP1Q00587 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CDC42EP1Q00587 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CDC42EP1Q00587 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CDC42EP1Q00587 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CDC42EP1Q00587 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CDC42EP1Q00587 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CDC42EP1Q00587 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CDC42EP1Q00587 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CDC42EP1Q00587 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CDC42EP1Q00587 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
CDC42EP1Q00587 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CDC42EP1Q00587 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CDC42EP1Q00587 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CDC42EP1Q00587 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CDC42EP1Q00587 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CDC42EP1Q00587 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CDC42EP1Q00587 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CDC42EP1Q00587 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CDC42EP1Q00587 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CDC42EP1Q00587 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CDC42EP1Q00587 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CDC42EP1Q00587 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
CDC42EP1Q00587 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CDC42EP1Q00587 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CDC42EP1Q00587 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CDC42EP1Q00587 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CDC42EP1Q00587 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CDC42EP1Q00587 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CDC42EP1Q00587 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CDC42EP1Q00587 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CDC42EP1Q00587 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CDC42EP1Q00587 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CDC42EP1Q00587 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CDC42EP1Q00587 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CDC42EP1Q00587 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CDC42EP1Q00587 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CDC42EP1Q00587 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CDC42EP1Q00587 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CDC42EP1Q00587 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CDC42EP1Q00587 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CDC42EP1Q00587 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CDC42EP1Q00587 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CDC42EP1Q00587 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
CDC42EP1Q00587 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CDC42EP1Q00587 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CDC42EP1Q00587 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CDC42EP1Q00587 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CDC42EP1Q00587 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CDC42EP1Q00587 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CDC42EP1Q00587 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CDC42EP1Q00587 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CDC42EP1Q00587 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CDC42EP1Q00587 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CDC42EP1Q00587 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CDC42EP1Q00587 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CDC42EP1Q00587 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CDC42EP1Q00587 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CDC42EP1Q00587 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CDC42EP1Q00587 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CDC42EP1Q00587 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CDC42EP1Q00587 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CDC42EP1Q00587 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CDC42EP1Q00587 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CDC42EP1Q00587 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CDC42EP1Q00587 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CDC42EP1Q00587 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CDC42EP1Q00587 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CDC42EP1Q00587 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CDC42EP1Q00587 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CDC42EP1Q00587 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CDC42EP1Q00587 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CDC42EP1Q00587 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CDC42EP1Q00587 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CDC42EP1Q00587 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.66
CDC42EP1Q00587 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CDC42EP1Q00587 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CDC42EP1Q00587 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CDC42EP1Q00587 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CDC42EP1Q00587 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CDC42EP1Q00587 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CDC42EP1Q00587 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CDC42EP1Q00587 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CDC42EP1Q00587 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CDC42EP1Q00587 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CDC42EP1Q00587 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms