Protein–RNA interactions for Protein: Q00536

CDK16, Cyclin-dependent kinase 16, humanhuman

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK16Q00536 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDK16Q00536 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDK16Q00536 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CDK16Q00536 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDK16Q00536 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDK16Q00536 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDK16Q00536 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDK16Q00536 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDK16Q00536 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDK16Q00536 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDK16Q00536 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDK16Q00536 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDK16Q00536 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDK16Q00536 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDK16Q00536 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDK16Q00536 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDK16Q00536 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDK16Q00536 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDK16Q00536 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDK16Q00536 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDK16Q00536 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDK16Q00536 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDK16Q00536 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDK16Q00536 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDK16Q00536 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDK16Q00536 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDK16Q00536 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDK16Q00536 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDK16Q00536 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDK16Q00536 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDK16Q00536 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDK16Q00536 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDK16Q00536 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDK16Q00536 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CDK16Q00536 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDK16Q00536 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDK16Q00536 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDK16Q00536 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDK16Q00536 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDK16Q00536 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
CDK16Q00536 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CDK16Q00536 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CDK16Q00536 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CDK16Q00536 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CDK16Q00536 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CDK16Q00536 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CDK16Q00536 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDK16Q00536 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDK16Q00536 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDK16Q00536 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDK16Q00536 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDK16Q00536 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDK16Q00536 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDK16Q00536 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDK16Q00536 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDK16Q00536 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDK16Q00536 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDK16Q00536 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDK16Q00536 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDK16Q00536 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDK16Q00536 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDK16Q00536 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDK16Q00536 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDK16Q00536 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CDK16Q00536 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDK16Q00536 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDK16Q00536 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CDK16Q00536 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDK16Q00536 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDK16Q00536 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDK16Q00536 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDK16Q00536 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDK16Q00536 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDK16Q00536 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDK16Q00536 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDK16Q00536 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDK16Q00536 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDK16Q00536 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDK16Q00536 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDK16Q00536 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDK16Q00536 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDK16Q00536 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDK16Q00536 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDK16Q00536 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDK16Q00536 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDK16Q00536 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDK16Q00536 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDK16Q00536 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDK16Q00536 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDK16Q00536 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDK16Q00536 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDK16Q00536 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDK16Q00536 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDK16Q00536 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDK16Q00536 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CDK16Q00536 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CDK16Q00536 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CDK16Q00536 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CDK16Q00536 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CDK16Q00536 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms