Protein–RNA interactions for Protein: Q00526

CDK3, Cyclin-dependent kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK3Q00526 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDK3Q00526 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDK3Q00526 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDK3Q00526 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDK3Q00526 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDK3Q00526 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDK3Q00526 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDK3Q00526 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDK3Q00526 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDK3Q00526 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDK3Q00526 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDK3Q00526 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDK3Q00526 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDK3Q00526 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDK3Q00526 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDK3Q00526 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDK3Q00526 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDK3Q00526 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDK3Q00526 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDK3Q00526 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDK3Q00526 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDK3Q00526 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDK3Q00526 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDK3Q00526 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDK3Q00526 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDK3Q00526 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDK3Q00526 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDK3Q00526 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDK3Q00526 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDK3Q00526 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDK3Q00526 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDK3Q00526 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDK3Q00526 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDK3Q00526 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDK3Q00526 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDK3Q00526 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDK3Q00526 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDK3Q00526 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CDK3Q00526 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDK3Q00526 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CDK3Q00526 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDK3Q00526 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDK3Q00526 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDK3Q00526 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDK3Q00526 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDK3Q00526 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CDK3Q00526 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDK3Q00526 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDK3Q00526 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDK3Q00526 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDK3Q00526 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDK3Q00526 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDK3Q00526 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDK3Q00526 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDK3Q00526 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDK3Q00526 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDK3Q00526 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDK3Q00526 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDK3Q00526 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDK3Q00526 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDK3Q00526 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDK3Q00526 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDK3Q00526 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDK3Q00526 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDK3Q00526 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDK3Q00526 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDK3Q00526 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDK3Q00526 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDK3Q00526 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDK3Q00526 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDK3Q00526 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDK3Q00526 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDK3Q00526 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDK3Q00526 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CDK3Q00526 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDK3Q00526 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDK3Q00526 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CDK3Q00526 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CDK3Q00526 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CDK3Q00526 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDK3Q00526 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDK3Q00526 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDK3Q00526 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDK3Q00526 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDK3Q00526 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDK3Q00526 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDK3Q00526 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDK3Q00526 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CDK3Q00526 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDK3Q00526 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CDK3Q00526 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CDK3Q00526 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDK3Q00526 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDK3Q00526 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDK3Q00526 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDK3Q00526 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDK3Q00526 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDK3Q00526 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDK3Q00526 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDK3Q00526 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms