Protein–RNA interactions for Protein: P78545

ELF3, ETS-related transcription factor Elf-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELF3P78545 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ELF3P78545 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ELF3P78545 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ELF3P78545 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ELF3P78545 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ELF3P78545 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ELF3P78545 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ELF3P78545 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ELF3P78545 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ELF3P78545 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ELF3P78545 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ELF3P78545 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ELF3P78545 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ELF3P78545 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ELF3P78545 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ELF3P78545 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ELF3P78545 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ELF3P78545 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ELF3P78545 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ELF3P78545 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ELF3P78545 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ELF3P78545 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ELF3P78545 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ELF3P78545 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ELF3P78545 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ELF3P78545 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ELF3P78545 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ELF3P78545 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ELF3P78545 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ELF3P78545 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ELF3P78545 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ELF3P78545 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ELF3P78545 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ELF3P78545 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ELF3P78545 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ELF3P78545 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ELF3P78545 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ELF3P78545 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ELF3P78545 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ELF3P78545 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ELF3P78545 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ELF3P78545 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ELF3P78545 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ELF3P78545 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ELF3P78545 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ELF3P78545 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ELF3P78545 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ELF3P78545 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ELF3P78545 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ELF3P78545 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ELF3P78545 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ELF3P78545 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ELF3P78545 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ELF3P78545 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ELF3P78545 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ELF3P78545 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ELF3P78545 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ELF3P78545 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ELF3P78545 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ELF3P78545 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ELF3P78545 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ELF3P78545 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ELF3P78545 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ELF3P78545 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ELF3P78545 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ELF3P78545 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ELF3P78545 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ELF3P78545 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ELF3P78545 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ELF3P78545 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ELF3P78545 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ELF3P78545 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ELF3P78545 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ELF3P78545 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ELF3P78545 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ELF3P78545 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ELF3P78545 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ELF3P78545 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ELF3P78545 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ELF3P78545 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ELF3P78545 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ELF3P78545 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ELF3P78545 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ELF3P78545 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ELF3P78545 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ELF3P78545 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ELF3P78545 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ELF3P78545 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ELF3P78545 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ELF3P78545 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ELF3P78545 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ELF3P78545 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ELF3P78545 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ELF3P78545 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ELF3P78545 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ELF3P78545 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ELF3P78545 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ELF3P78545 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ELF3P78545 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
ELF3P78545 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms