Protein–RNA interactions for Protein: P61550

ERVS71-1, Endogenous retrovirus group S71 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVS71-1P61550 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERVS71-1P61550 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERVS71-1P61550 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERVS71-1P61550 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERVS71-1P61550 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERVS71-1P61550 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERVS71-1P61550 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERVS71-1P61550 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERVS71-1P61550 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERVS71-1P61550 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERVS71-1P61550 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERVS71-1P61550 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERVS71-1P61550 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERVS71-1P61550 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERVS71-1P61550 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERVS71-1P61550 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERVS71-1P61550 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERVS71-1P61550 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERVS71-1P61550 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERVS71-1P61550 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERVS71-1P61550 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERVS71-1P61550 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERVS71-1P61550 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERVS71-1P61550 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERVS71-1P61550 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ERVS71-1P61550 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERVS71-1P61550 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERVS71-1P61550 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERVS71-1P61550 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERVS71-1P61550 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERVS71-1P61550 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERVS71-1P61550 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERVS71-1P61550 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERVS71-1P61550 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERVS71-1P61550 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERVS71-1P61550 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERVS71-1P61550 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ERVS71-1P61550 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ERVS71-1P61550 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ERVS71-1P61550 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ERVS71-1P61550 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ERVS71-1P61550 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ERVS71-1P61550 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ERVS71-1P61550 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ERVS71-1P61550 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ERVS71-1P61550 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ERVS71-1P61550 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ERVS71-1P61550 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ERVS71-1P61550 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ERVS71-1P61550 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ERVS71-1P61550 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ERVS71-1P61550 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ERVS71-1P61550 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ERVS71-1P61550 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ERVS71-1P61550 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ERVS71-1P61550 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ERVS71-1P61550 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ERVS71-1P61550 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ERVS71-1P61550 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ERVS71-1P61550 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ERVS71-1P61550 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ERVS71-1P61550 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ERVS71-1P61550 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ERVS71-1P61550 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ERVS71-1P61550 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ERVS71-1P61550 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ERVS71-1P61550 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ERVS71-1P61550 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ERVS71-1P61550 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ERVS71-1P61550 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ERVS71-1P61550 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ERVS71-1P61550 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ERVS71-1P61550 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ERVS71-1P61550 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ERVS71-1P61550 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ERVS71-1P61550 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ERVS71-1P61550 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ERVS71-1P61550 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ERVS71-1P61550 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ERVS71-1P61550 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ERVS71-1P61550 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ERVS71-1P61550 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ERVS71-1P61550 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ERVS71-1P61550 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ERVS71-1P61550 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ERVS71-1P61550 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ERVS71-1P61550 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ERVS71-1P61550 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ERVS71-1P61550 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ERVS71-1P61550 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ERVS71-1P61550 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ERVS71-1P61550 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ERVS71-1P61550 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ERVS71-1P61550 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ERVS71-1P61550 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ERVS71-1P61550 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ERVS71-1P61550 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ERVS71-1P61550 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ERVS71-1P61550 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ERVS71-1P61550 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms