Protein–RNA interactions for Protein: P60983

GMFB, Glia maturation factor beta, humanhuman

Predictions only

Length 142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GMFBP60983 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GMFBP60983 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GMFBP60983 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GMFBP60983 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GMFBP60983 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
GMFBP60983 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GMFBP60983 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GMFBP60983 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GMFBP60983 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GMFBP60983 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GMFBP60983 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GMFBP60983 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GMFBP60983 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GMFBP60983 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GMFBP60983 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GMFBP60983 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GMFBP60983 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GMFBP60983 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GMFBP60983 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
GMFBP60983 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GMFBP60983 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GMFBP60983 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GMFBP60983 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GMFBP60983 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GMFBP60983 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
GMFBP60983 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GMFBP60983 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GMFBP60983 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GMFBP60983 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GMFBP60983 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GMFBP60983 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GMFBP60983 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GMFBP60983 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GMFBP60983 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GMFBP60983 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GMFBP60983 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GMFBP60983 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GMFBP60983 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GMFBP60983 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GMFBP60983 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GMFBP60983 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GMFBP60983 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GMFBP60983 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GMFBP60983 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GMFBP60983 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GMFBP60983 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
GMFBP60983 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GMFBP60983 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GMFBP60983 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
GMFBP60983 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
GMFBP60983 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GMFBP60983 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GMFBP60983 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GMFBP60983 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
GMFBP60983 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GMFBP60983 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
GMFBP60983 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
GMFBP60983 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GMFBP60983 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GMFBP60983 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GMFBP60983 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GMFBP60983 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GMFBP60983 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GMFBP60983 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GMFBP60983 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GMFBP60983 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GMFBP60983 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GMFBP60983 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GMFBP60983 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GMFBP60983 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GMFBP60983 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GMFBP60983 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GMFBP60983 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GMFBP60983 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GMFBP60983 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
GMFBP60983 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GMFBP60983 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GMFBP60983 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GMFBP60983 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GMFBP60983 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GMFBP60983 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GMFBP60983 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GMFBP60983 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GMFBP60983 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GMFBP60983 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GMFBP60983 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GMFBP60983 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GMFBP60983 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GMFBP60983 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GMFBP60983 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GMFBP60983 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GMFBP60983 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GMFBP60983 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GMFBP60983 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GMFBP60983 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GMFBP60983 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GMFBP60983 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GMFBP60983 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GMFBP60983 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GMFBP60983 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms