Protein–RNA interactions for Protein: P57055

RIPPLY3, Protein ripply3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPPLY3P57055 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
RIPPLY3P57055 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RIPPLY3P57055 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
RIPPLY3P57055 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RIPPLY3P57055 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RIPPLY3P57055 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RIPPLY3P57055 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RIPPLY3P57055 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RIPPLY3P57055 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RIPPLY3P57055 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RIPPLY3P57055 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RIPPLY3P57055 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RIPPLY3P57055 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RIPPLY3P57055 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RIPPLY3P57055 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RIPPLY3P57055 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RIPPLY3P57055 TPT1-AS1-203ENST00000412946 744 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RIPPLY3P57055 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
RIPPLY3P57055 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RIPPLY3P57055 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
RIPPLY3P57055 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RIPPLY3P57055 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RIPPLY3P57055 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RIPPLY3P57055 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RIPPLY3P57055 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RIPPLY3P57055 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RIPPLY3P57055 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RIPPLY3P57055 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RIPPLY3P57055 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RIPPLY3P57055 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RIPPLY3P57055 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RIPPLY3P57055 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RIPPLY3P57055 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RIPPLY3P57055 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RIPPLY3P57055 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
RIPPLY3P57055 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RIPPLY3P57055 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RIPPLY3P57055 UBE2V2-205ENST00000521346 1322 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RIPPLY3P57055 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RIPPLY3P57055 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RIPPLY3P57055 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RIPPLY3P57055 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RIPPLY3P57055 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RIPPLY3P57055 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RIPPLY3P57055 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RIPPLY3P57055 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RIPPLY3P57055 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RIPPLY3P57055 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RIPPLY3P57055 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
RIPPLY3P57055 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RIPPLY3P57055 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RIPPLY3P57055 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RIPPLY3P57055 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RIPPLY3P57055 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RIPPLY3P57055 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RIPPLY3P57055 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RIPPLY3P57055 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RIPPLY3P57055 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RIPPLY3P57055 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RIPPLY3P57055 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RIPPLY3P57055 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RIPPLY3P57055 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RIPPLY3P57055 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RIPPLY3P57055 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RIPPLY3P57055 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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RIPPLY3P57055 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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RIPPLY3P57055 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RIPPLY3P57055 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RIPPLY3P57055 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RIPPLY3P57055 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RIPPLY3P57055 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RIPPLY3P57055 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RIPPLY3P57055 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RIPPLY3P57055 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RIPPLY3P57055 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
RIPPLY3P57055 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RIPPLY3P57055 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RIPPLY3P57055 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RIPPLY3P57055 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RIPPLY3P57055 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RIPPLY3P57055 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RIPPLY3P57055 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RIPPLY3P57055 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RIPPLY3P57055 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RIPPLY3P57055 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RIPPLY3P57055 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RIPPLY3P57055 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RIPPLY3P57055 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RIPPLY3P57055 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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