Protein–RNA interactions for Protein: P49848

TAF6, Transcription initiation factor TFIID subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF6P49848 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TAF6P49848 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TAF6P49848 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TAF6P49848 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TAF6P49848 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TAF6P49848 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TAF6P49848 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TAF6P49848 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TAF6P49848 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TAF6P49848 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TAF6P49848 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TAF6P49848 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TAF6P49848 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TAF6P49848 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TAF6P49848 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TAF6P49848 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TAF6P49848 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TAF6P49848 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TAF6P49848 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TAF6P49848 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TAF6P49848 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TAF6P49848 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TAF6P49848 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TAF6P49848 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TAF6P49848 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TAF6P49848 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
TAF6P49848 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TAF6P49848 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TAF6P49848 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
TAF6P49848 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
TAF6P49848 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
TAF6P49848 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
TAF6P49848 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TAF6P49848 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TAF6P49848 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TAF6P49848 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TAF6P49848 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TAF6P49848 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TAF6P49848 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TAF6P49848 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TAF6P49848 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TAF6P49848 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TAF6P49848 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TAF6P49848 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TAF6P49848 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TAF6P49848 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TAF6P49848 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TAF6P49848 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TAF6P49848 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TAF6P49848 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TAF6P49848 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TAF6P49848 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TAF6P49848 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TAF6P49848 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TAF6P49848 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TAF6P49848 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TAF6P49848 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TAF6P49848 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
TAF6P49848 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TAF6P49848 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TAF6P49848 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TAF6P49848 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TAF6P49848 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TAF6P49848 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
TAF6P49848 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TAF6P49848 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TAF6P49848 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
TAF6P49848 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
TAF6P49848 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TAF6P49848 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TAF6P49848 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TAF6P49848 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TAF6P49848 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TAF6P49848 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TAF6P49848 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TAF6P49848 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
TAF6P49848 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TAF6P49848 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TAF6P49848 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TAF6P49848 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TAF6P49848 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TAF6P49848 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TAF6P49848 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TAF6P49848 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
TAF6P49848 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TAF6P49848 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TAF6P49848 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TAF6P49848 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TAF6P49848 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
TAF6P49848 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TAF6P49848 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TAF6P49848 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TAF6P49848 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TAF6P49848 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
TAF6P49848 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TAF6P49848 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
TAF6P49848 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
TAF6P49848 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
TAF6P49848 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TAF6P49848 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms