Protein–RNA interactions for Protein: P42575

CASP2, Caspase-2, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP2P42575 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CASP2P42575 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CASP2P42575 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CASP2P42575 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CASP2P42575 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CASP2P42575 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CASP2P42575 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CASP2P42575 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CASP2P42575 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CASP2P42575 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CASP2P42575 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CASP2P42575 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CASP2P42575 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CASP2P42575 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CASP2P42575 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CASP2P42575 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CASP2P42575 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CASP2P42575 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CASP2P42575 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CASP2P42575 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CASP2P42575 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CASP2P42575 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CASP2P42575 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CASP2P42575 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CASP2P42575 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CASP2P42575 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CASP2P42575 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CASP2P42575 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CASP2P42575 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CASP2P42575 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CASP2P42575 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CASP2P42575 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CASP2P42575 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CASP2P42575 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CASP2P42575 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CASP2P42575 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CASP2P42575 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CASP2P42575 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CASP2P42575 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CASP2P42575 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CASP2P42575 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CASP2P42575 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CASP2P42575 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CASP2P42575 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CASP2P42575 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CASP2P42575 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CASP2P42575 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CASP2P42575 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CASP2P42575 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CASP2P42575 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CASP2P42575 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CASP2P42575 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CASP2P42575 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CASP2P42575 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CASP2P42575 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CASP2P42575 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CASP2P42575 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CASP2P42575 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CASP2P42575 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CASP2P42575 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CASP2P42575 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CASP2P42575 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CASP2P42575 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CASP2P42575 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CASP2P42575 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CASP2P42575 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CASP2P42575 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CASP2P42575 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CASP2P42575 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CASP2P42575 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CASP2P42575 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CASP2P42575 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CASP2P42575 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CASP2P42575 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CASP2P42575 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CASP2P42575 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CASP2P42575 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CASP2P42575 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CASP2P42575 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CASP2P42575 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CASP2P42575 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CASP2P42575 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CASP2P42575 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CASP2P42575 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CASP2P42575 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CASP2P42575 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CASP2P42575 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CASP2P42575 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CASP2P42575 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CASP2P42575 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CASP2P42575 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CASP2P42575 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CASP2P42575 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CASP2P42575 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CASP2P42575 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CASP2P42575 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CASP2P42575 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CASP2P42575 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CASP2P42575 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CASP2P42575 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms