Protein–RNA interactions for Protein: P38571

LIPA, Lysosomal acid lipase/cholesteryl ester hydrolase, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIPAP38571 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LIPAP38571 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LIPAP38571 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LIPAP38571 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LIPAP38571 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LIPAP38571 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LIPAP38571 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
LIPAP38571 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LIPAP38571 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LIPAP38571 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
LIPAP38571 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LIPAP38571 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LIPAP38571 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LIPAP38571 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LIPAP38571 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
LIPAP38571 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LIPAP38571 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LIPAP38571 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LIPAP38571 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LIPAP38571 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LIPAP38571 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LIPAP38571 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LIPAP38571 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LIPAP38571 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LIPAP38571 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LIPAP38571 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LIPAP38571 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LIPAP38571 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LIPAP38571 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LIPAP38571 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LIPAP38571 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LIPAP38571 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LIPAP38571 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LIPAP38571 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LIPAP38571 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LIPAP38571 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LIPAP38571 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LIPAP38571 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LIPAP38571 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LIPAP38571 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LIPAP38571 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
LIPAP38571 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LIPAP38571 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LIPAP38571 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LIPAP38571 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LIPAP38571 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LIPAP38571 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
LIPAP38571 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LIPAP38571 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LIPAP38571 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LIPAP38571 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LIPAP38571 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LIPAP38571 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LIPAP38571 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LIPAP38571 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LIPAP38571 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LIPAP38571 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LIPAP38571 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LIPAP38571 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LIPAP38571 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LIPAP38571 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LIPAP38571 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LIPAP38571 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LIPAP38571 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LIPAP38571 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LIPAP38571 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LIPAP38571 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LIPAP38571 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LIPAP38571 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LIPAP38571 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LIPAP38571 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LIPAP38571 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
LIPAP38571 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LIPAP38571 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LIPAP38571 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LIPAP38571 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
LIPAP38571 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LIPAP38571 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LIPAP38571 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LIPAP38571 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LIPAP38571 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LIPAP38571 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LIPAP38571 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LIPAP38571 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
LIPAP38571 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LIPAP38571 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LIPAP38571 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LIPAP38571 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LIPAP38571 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LIPAP38571 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LIPAP38571 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LIPAP38571 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LIPAP38571 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LIPAP38571 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LIPAP38571 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LIPAP38571 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LIPAP38571 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LIPAP38571 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LIPAP38571 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LIPAP38571 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms