Protein–RNA interactions for Protein: P38570

ITGAE, Integrin alpha-E, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAEP38570 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ITGAEP38570 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ITGAEP38570 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ITGAEP38570 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ITGAEP38570 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ITGAEP38570 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ITGAEP38570 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ITGAEP38570 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ITGAEP38570 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ITGAEP38570 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ITGAEP38570 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ITGAEP38570 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ITGAEP38570 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ITGAEP38570 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ITGAEP38570 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ITGAEP38570 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ITGAEP38570 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ITGAEP38570 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
ITGAEP38570 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ITGAEP38570 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ITGAEP38570 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ITGAEP38570 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ITGAEP38570 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ITGAEP38570 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ITGAEP38570 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ITGAEP38570 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ITGAEP38570 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ITGAEP38570 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ITGAEP38570 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ITGAEP38570 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ITGAEP38570 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ITGAEP38570 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ITGAEP38570 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ITGAEP38570 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ITGAEP38570 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ITGAEP38570 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ITGAEP38570 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ITGAEP38570 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
ITGAEP38570 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ITGAEP38570 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ITGAEP38570 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
ITGAEP38570 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
ITGAEP38570 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ITGAEP38570 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ITGAEP38570 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ITGAEP38570 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
ITGAEP38570 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ITGAEP38570 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ITGAEP38570 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ITGAEP38570 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ITGAEP38570 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ITGAEP38570 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ITGAEP38570 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ITGAEP38570 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ITGAEP38570 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ITGAEP38570 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ITGAEP38570 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ITGAEP38570 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
ITGAEP38570 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ITGAEP38570 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ITGAEP38570 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ITGAEP38570 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ITGAEP38570 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ITGAEP38570 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ITGAEP38570 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ITGAEP38570 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ITGAEP38570 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ITGAEP38570 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ITGAEP38570 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ITGAEP38570 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ITGAEP38570 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ITGAEP38570 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ITGAEP38570 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ITGAEP38570 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ITGAEP38570 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ITGAEP38570 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ITGAEP38570 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ITGAEP38570 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
ITGAEP38570 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ITGAEP38570 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ITGAEP38570 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ITGAEP38570 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
ITGAEP38570 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ITGAEP38570 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ITGAEP38570 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
ITGAEP38570 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
ITGAEP38570 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
ITGAEP38570 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ITGAEP38570 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ITGAEP38570 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ITGAEP38570 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ITGAEP38570 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ITGAEP38570 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ITGAEP38570 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ITGAEP38570 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ITGAEP38570 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ITGAEP38570 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ITGAEP38570 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
ITGAEP38570 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ITGAEP38570 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms