Protein–RNA interactions for Protein: P38117

ETFB, Electron transfer flavoprotein subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETFBP38117 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ETFBP38117 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ETFBP38117 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ETFBP38117 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ETFBP38117 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ETFBP38117 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ETFBP38117 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ETFBP38117 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ETFBP38117 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ETFBP38117 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ETFBP38117 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ETFBP38117 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ETFBP38117 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ETFBP38117 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ETFBP38117 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ETFBP38117 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ETFBP38117 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ETFBP38117 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ETFBP38117 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ETFBP38117 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ETFBP38117 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ETFBP38117 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ETFBP38117 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ETFBP38117 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ETFBP38117 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ETFBP38117 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ETFBP38117 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ETFBP38117 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ETFBP38117 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ETFBP38117 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ETFBP38117 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ETFBP38117 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ETFBP38117 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ETFBP38117 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ETFBP38117 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ETFBP38117 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ETFBP38117 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ETFBP38117 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ETFBP38117 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ETFBP38117 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ETFBP38117 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ETFBP38117 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ETFBP38117 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ETFBP38117 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ETFBP38117 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ETFBP38117 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ETFBP38117 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ETFBP38117 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ETFBP38117 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ETFBP38117 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ETFBP38117 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ETFBP38117 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ETFBP38117 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ETFBP38117 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ETFBP38117 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ETFBP38117 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ETFBP38117 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ETFBP38117 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ETFBP38117 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ETFBP38117 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ETFBP38117 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ETFBP38117 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ETFBP38117 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ETFBP38117 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ETFBP38117 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ETFBP38117 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ETFBP38117 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ETFBP38117 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ETFBP38117 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ETFBP38117 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ETFBP38117 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
ETFBP38117 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ETFBP38117 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ETFBP38117 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ETFBP38117 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ETFBP38117 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ETFBP38117 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ETFBP38117 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ETFBP38117 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ETFBP38117 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ETFBP38117 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ETFBP38117 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ETFBP38117 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
ETFBP38117 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ETFBP38117 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ETFBP38117 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ETFBP38117 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ETFBP38117 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
ETFBP38117 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ETFBP38117 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ETFBP38117 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ETFBP38117 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ETFBP38117 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
ETFBP38117 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ETFBP38117 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ETFBP38117 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ETFBP38117 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ETFBP38117 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ETFBP38117 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ETFBP38117 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms