Protein–RNA interactions for Protein: P35606

COPB2, Coatomer subunit beta', humanhuman

Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPB2P35606 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
COPB2P35606 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
COPB2P35606 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
COPB2P35606 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
COPB2P35606 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
COPB2P35606 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
COPB2P35606 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
COPB2P35606 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
COPB2P35606 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
COPB2P35606 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
COPB2P35606 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
COPB2P35606 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
COPB2P35606 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
COPB2P35606 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
COPB2P35606 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
COPB2P35606 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
COPB2P35606 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
COPB2P35606 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
COPB2P35606 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
COPB2P35606 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
COPB2P35606 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
COPB2P35606 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
COPB2P35606 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
COPB2P35606 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
COPB2P35606 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
COPB2P35606 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
COPB2P35606 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
COPB2P35606 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
COPB2P35606 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
COPB2P35606 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
COPB2P35606 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
COPB2P35606 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
COPB2P35606 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
COPB2P35606 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
COPB2P35606 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
COPB2P35606 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
COPB2P35606 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
COPB2P35606 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
COPB2P35606 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
COPB2P35606 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
COPB2P35606 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
COPB2P35606 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
COPB2P35606 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
COPB2P35606 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
COPB2P35606 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
COPB2P35606 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
COPB2P35606 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
COPB2P35606 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
COPB2P35606 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
COPB2P35606 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
COPB2P35606 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
COPB2P35606 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
COPB2P35606 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
COPB2P35606 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
COPB2P35606 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
COPB2P35606 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
COPB2P35606 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
COPB2P35606 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
COPB2P35606 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
COPB2P35606 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
COPB2P35606 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
COPB2P35606 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
COPB2P35606 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
COPB2P35606 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
COPB2P35606 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
COPB2P35606 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
COPB2P35606 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
COPB2P35606 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
COPB2P35606 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
COPB2P35606 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
COPB2P35606 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
COPB2P35606 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
COPB2P35606 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
COPB2P35606 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
COPB2P35606 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
COPB2P35606 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
COPB2P35606 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
COPB2P35606 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
COPB2P35606 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
COPB2P35606 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
COPB2P35606 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
COPB2P35606 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
COPB2P35606 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
COPB2P35606 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
COPB2P35606 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
COPB2P35606 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
COPB2P35606 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
COPB2P35606 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
COPB2P35606 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
COPB2P35606 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
COPB2P35606 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
COPB2P35606 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
COPB2P35606 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
COPB2P35606 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
COPB2P35606 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
COPB2P35606 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
COPB2P35606 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
COPB2P35606 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
COPB2P35606 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
COPB2P35606 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.3 ms