Protein–RNA interactions for Protein: P35212

GJA4, Gap junction alpha-4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA4P35212 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GJA4P35212 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GJA4P35212 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GJA4P35212 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GJA4P35212 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GJA4P35212 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GJA4P35212 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GJA4P35212 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GJA4P35212 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
GJA4P35212 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GJA4P35212 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GJA4P35212 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
GJA4P35212 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GJA4P35212 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GJA4P35212 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GJA4P35212 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GJA4P35212 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GJA4P35212 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GJA4P35212 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GJA4P35212 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GJA4P35212 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GJA4P35212 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GJA4P35212 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GJA4P35212 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GJA4P35212 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GJA4P35212 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GJA4P35212 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GJA4P35212 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GJA4P35212 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GJA4P35212 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GJA4P35212 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GJA4P35212 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GJA4P35212 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GJA4P35212 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GJA4P35212 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GJA4P35212 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
GJA4P35212 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GJA4P35212 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GJA4P35212 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GJA4P35212 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GJA4P35212 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GJA4P35212 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
GJA4P35212 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
GJA4P35212 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GJA4P35212 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GJA4P35212 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GJA4P35212 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
GJA4P35212 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
GJA4P35212 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GJA4P35212 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
GJA4P35212 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
GJA4P35212 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
GJA4P35212 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GJA4P35212 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GJA4P35212 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GJA4P35212 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GJA4P35212 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GJA4P35212 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GJA4P35212 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GJA4P35212 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GJA4P35212 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GJA4P35212 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GJA4P35212 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GJA4P35212 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GJA4P35212 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GJA4P35212 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GJA4P35212 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GJA4P35212 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GJA4P35212 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GJA4P35212 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GJA4P35212 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GJA4P35212 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GJA4P35212 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GJA4P35212 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GJA4P35212 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GJA4P35212 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GJA4P35212 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
GJA4P35212 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GJA4P35212 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GJA4P35212 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GJA4P35212 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GJA4P35212 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GJA4P35212 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GJA4P35212 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GJA4P35212 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GJA4P35212 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GJA4P35212 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GJA4P35212 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GJA4P35212 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
GJA4P35212 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GJA4P35212 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GJA4P35212 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GJA4P35212 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GJA4P35212 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GJA4P35212 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GJA4P35212 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GJA4P35212 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GJA4P35212 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GJA4P35212 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GJA4P35212 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms