Protein–RNA interactions for Protein: P33527

ABCC1, Multidrug resistance-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC1P33527 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ABCC1P33527 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ABCC1P33527 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.8
ABCC1P33527 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ABCC1P33527 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ABCC1P33527 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ABCC1P33527 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ABCC1P33527 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ABCC1P33527 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ABCC1P33527 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ABCC1P33527 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ABCC1P33527 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ABCC1P33527 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
ABCC1P33527 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ABCC1P33527 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ABCC1P33527 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
ABCC1P33527 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ABCC1P33527 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ABCC1P33527 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ABCC1P33527 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ABCC1P33527 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ABCC1P33527 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ABCC1P33527 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ABCC1P33527 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ABCC1P33527 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ABCC1P33527 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ABCC1P33527 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ABCC1P33527 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ABCC1P33527 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ABCC1P33527 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ABCC1P33527 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
ABCC1P33527 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ABCC1P33527 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ABCC1P33527 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ABCC1P33527 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ABCC1P33527 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ABCC1P33527 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ABCC1P33527 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ABCC1P33527 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ABCC1P33527 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ABCC1P33527 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ABCC1P33527 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ABCC1P33527 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ABCC1P33527 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
ABCC1P33527 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
ABCC1P33527 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
ABCC1P33527 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ABCC1P33527 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ABCC1P33527 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ABCC1P33527 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ABCC1P33527 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ABCC1P33527 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ABCC1P33527 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ABCC1P33527 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ABCC1P33527 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ABCC1P33527 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ABCC1P33527 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ABCC1P33527 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ABCC1P33527 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ABCC1P33527 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ABCC1P33527 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ABCC1P33527 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ABCC1P33527 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ABCC1P33527 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ABCC1P33527 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ABCC1P33527 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ABCC1P33527 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ABCC1P33527 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ABCC1P33527 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ABCC1P33527 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ABCC1P33527 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ABCC1P33527 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ABCC1P33527 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ABCC1P33527 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
ABCC1P33527 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
ABCC1P33527 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ABCC1P33527 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ABCC1P33527 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ABCC1P33527 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ABCC1P33527 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ABCC1P33527 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ABCC1P33527 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ABCC1P33527 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ABCC1P33527 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ABCC1P33527 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ABCC1P33527 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ABCC1P33527 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ABCC1P33527 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ABCC1P33527 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ABCC1P33527 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ABCC1P33527 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ABCC1P33527 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ABCC1P33527 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ABCC1P33527 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ABCC1P33527 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
ABCC1P33527 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
ABCC1P33527 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
ABCC1P33527 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ABCC1P33527 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ABCC1P33527 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms