Protein–RNA interactions for Protein: P31275

HOXC12, Homeobox protein Hox-C12, humanhuman

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC12P31275 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXC12P31275 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXC12P31275 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXC12P31275 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXC12P31275 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXC12P31275 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
HOXC12P31275 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
HOXC12P31275 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
HOXC12P31275 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
HOXC12P31275 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
HOXC12P31275 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXC12P31275 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXC12P31275 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXC12P31275 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXC12P31275 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXC12P31275 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXC12P31275 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXC12P31275 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXC12P31275 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXC12P31275 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXC12P31275 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXC12P31275 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXC12P31275 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXC12P31275 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXC12P31275 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXC12P31275 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXC12P31275 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXC12P31275 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXC12P31275 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXC12P31275 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXC12P31275 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXC12P31275 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXC12P31275 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXC12P31275 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXC12P31275 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXC12P31275 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXC12P31275 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXC12P31275 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXC12P31275 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXC12P31275 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXC12P31275 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXC12P31275 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXC12P31275 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXC12P31275 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXC12P31275 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXC12P31275 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXC12P31275 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXC12P31275 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXC12P31275 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXC12P31275 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXC12P31275 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXC12P31275 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXC12P31275 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXC12P31275 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXC12P31275 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXC12P31275 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXC12P31275 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXC12P31275 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HOXC12P31275 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HOXC12P31275 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HOXC12P31275 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HOXC12P31275 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HOXC12P31275 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HOXC12P31275 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HOXC12P31275 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HOXC12P31275 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HOXC12P31275 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HOXC12P31275 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HOXC12P31275 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HOXC12P31275 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HOXC12P31275 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HOXC12P31275 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
HOXC12P31275 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HOXC12P31275 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HOXC12P31275 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HOXC12P31275 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HOXC12P31275 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HOXC12P31275 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HOXC12P31275 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HOXC12P31275 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HOXC12P31275 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HOXC12P31275 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HOXC12P31275 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HOXC12P31275 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HOXC12P31275 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
HOXC12P31275 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HOXC12P31275 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HOXC12P31275 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HOXC12P31275 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HOXC12P31275 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HOXC12P31275 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HOXC12P31275 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HOXC12P31275 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HOXC12P31275 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HOXC12P31275 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HOXC12P31275 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HOXC12P31275 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HOXC12P31275 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
HOXC12P31275 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
HOXC12P31275 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms